Escherichia coli APEC O1 [gbbct]: 4890 CDS's (1598551 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 22.6( 36127)  UCU  8.9( 14277)  UAU 16.5( 26306)  UGU  5.4(  8659)
UUC 16.4( 26141)  UCC  8.9( 14300)  UAC 12.1( 19400)  UGC  6.5( 10463)
UUA 13.6( 21712)  UCA  8.3( 13256)  UAA  1.9(  2979)  UGA  1.0(  1536)
UUG 13.2( 21043)  UCG  8.9( 14247)  UAG  0.2(   375)  UGG 15.2( 24367)

CUU 12.1( 19336)  CCU  7.6( 12136)  CAU 13.0( 20809)  CGU 20.3( 32489)
CUC 11.0( 17619)  CCC  5.8(  9208)  CAC  9.4( 15104)  CGC 20.8( 33305)
CUA  4.0(  6381)  CCA  8.8( 14004)  CAA 14.8( 23716)  CGA  4.0(  6336)
CUG 50.2( 80301)  CCG 21.9( 35017)  CAG 29.3( 46806)  CGG  6.2(  9895)

AUU 29.9( 47799)  ACU  9.3( 14904)  AAU 18.6( 29672)  AGU  9.3( 14939)
AUC 24.2( 38750)  ACC 22.4( 35864)  AAC 21.4( 34283)  AGC 15.7( 25115)
AUA  5.3(  8501)  ACA  8.2( 13139)  AAA 33.5( 53487)  AGA  3.0(  4804)
AUG 27.5( 43892)  ACG 14.6( 23347)  AAG 11.2( 17837)  AGG  2.0(  3180)

GUU 18.7( 29962)  GCU 16.0( 25516)  GAU 32.4( 51782)  GGU 24.3( 38834)
GUC 15.0( 23912)  GCC 25.3( 40403)  GAC 19.0( 30356)  GGC 27.9( 44562)
GUA 11.2( 17875)  GCA 20.8( 33292)  GAA 38.7( 61906)  GGA  9.1( 14474)
GUG 25.4( 40582)  GCG 31.6( 50463)  GAG 18.3( 29279)  GGG 11.4( 18190)
Coding GC 51.42% 1st letter GC 58.42% 2nd letter GC 40.94% 3rd letter GC 54.90%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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