Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 [gbbct]: 7201 CDS's (2325855 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  0.4(   999)  UCU  0.6(  1505)  UAU  0.8(  1847)  UGU  0.4(   913)
UUC 28.1( 65440)  UCC 14.9( 34677)  UAC 18.0( 41943)  UGC  7.9( 18331)
UUA  0.1(   183)  UCA  1.0(  2275)  UAA  0.1(   227)  UGA  2.5(  5828)
UUG  5.1( 11799)  UCG 20.0( 46542)  UAG  0.5(  1146)  UGG 15.2( 35403)

CUU  1.9(  4341)  CCU  1.8(  4114)  CAU  1.4(  3343)  CGU  4.0(  9189)
CUC 30.7( 71444)  CCC 18.5( 42927)  CAC 22.1( 51363)  CGC 40.6( 94497)
CUA  0.5(  1186)  CCA  1.7(  3884)  CAA  1.8(  4227)  CGA  3.1(  7139)
CUG 65.3(151866)  CCG 37.0( 86161)  CAG 26.8( 62315)  CGG 30.5( 71033)

AUU  0.6(  1500)  ACU  1.2(  2900)  AAU  0.6(  1288)  AGU  1.1(  2573)
AUC 30.5( 70992)  ACC 36.4( 84614)  AAC 17.2( 39947)  AGC 15.0( 34876)
AUA  0.3(   808)  ACA  1.4(  3299)  AAA  1.1(  2594)  AGA  0.6(  1347)
AUG 16.6( 38508)  ACG 15.9( 36933)  AAG 16.5( 38347)  AGG  5.1( 11825)

GUU  2.3(  5447)  GCU  4.2(  9871)  GAU  4.7( 11023)  GGU 11.8( 27391)
GUC 44.2(102804)  GCC 61.9(143897)  GAC 55.2(128319)  GGC 56.1(130543)
GUA  1.1(  2599)  GCA  5.6( 13011)  GAA 10.0( 23268)  GGA  7.3( 17074)
GUG 43.3(100702)  GCG 59.2(137762)  GAG 50.8(118154)  GGG 18.7( 43552)

Coding GC 71.64% 1st letter GC 72.42% 2nd letter GC 50.13% 3rd letter GC 92.38%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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