Pseudomonas mendocina ymp [gbbct]: 4595 CDS's (1513293 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.7(  7169)  UCU  1.2(  1796)  UAU  6.4(  9724)  UGU  1.3(  1938)
UUC 30.4( 45983)  UCC 10.3( 15531)  UAC 18.4( 27812)  UGC  8.8( 13379)
UUA  0.6(   911)  UCA  1.1(  1734)  UAA  0.6(   893)  UGA  2.0(  2978)
UUG  7.7( 11644)  UCG 11.7( 17674)  UAG  0.5(   724)  UGG 14.5( 22010)

CUU  3.4(  5147)  CCU  2.9(  4425)  CAU  7.9( 11990)  CGU 12.1( 18327)
CUC 21.7( 32840)  CCC 14.0( 21194)  CAC 14.6( 22116)  CGC 45.5( 68905)
CUA  1.8(  2712)  CCA  3.0(  4481)  CAA  5.9(  8929)  CGA  2.1(  3178)
CUG 89.3(135202)  CCG 29.0( 43822)  CAG 41.9( 63390)  CGG  7.4( 11131)

AUU  5.8(  8847)  ACU  2.5(  3767)  AAU  5.6(  8477)  AGU  3.6(  5473)
AUC 37.8( 57191)  ACC 31.4( 47465)  AAC 21.8( 33029)  AGC 27.1( 40987)
AUA  1.3(  1959)  ACA  1.4(  2064)  AAA  5.1(  7689)  AGA  0.8(  1146)
AUG 21.7( 32845)  ACG  7.5( 11418)  AAG 25.9( 39253)  AGG  1.6(  2399)

GUU  3.7(  5671)  GCU  7.4( 11220)  GAU 16.3( 24725)  GGU 12.6( 19059)
GUC 22.8( 34535)  GCC 67.8(102545)  GAC 36.3( 54960)  GGC 56.9( 86078)
GUA  4.1(  6244)  GCA  7.3( 10993)  GAA 22.2( 33533)  GGA  2.3(  3506)
GUG 37.3( 56378)  GCG 32.6( 49338)  GAG 38.7( 58541)  GGG  8.1( 12269)

Coding GC 65.25% 1st letter GC 67.89% 2nd letter GC 43.76% 3rd letter GC 84.09%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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