Staphylothermus marinus F1 [gbbct]: 1570 CDS's (456391 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.2(  8751)  UCU 10.8(  4936)  UAU 38.5( 17560)  UGU  4.2(  1921)
UUC 16.5(  7516)  UCC  3.9(  1798)  UAC 12.8(  5839)  UGC  2.1(   938)
UUA 34.5( 15731)  UCA 13.3(  6083)  UAA  1.9(   849)  UGA  0.8(   344)
UUG 13.2(  6028)  UCG  3.5(  1613)  UAG  0.8(   377)  UGG 11.7(  5330)

CUU 17.8(  8125)  CCU 14.3(  6525)  CAU 12.6(  5770)  CGU  5.7(  2588)
CUC  9.1(  4162)  CCC  6.3(  2865)  CAC  4.8(  2192)  CGC  1.6(   732)
CUA 24.4( 11148)  CCA 18.2(  8318)  CAA 11.7(  5341)  CGA  2.8(  1258)
CUG  5.7(  2589)  CCG  4.7(  2137)  CAG  5.7(  2592)  CGG  1.2(   557)

AUU 36.0( 16425)  ACU 14.8(  6756)  AAU 27.9( 12744)  AGU 14.6(  6679)
AUC 13.4(  6129)  ACC  4.9(  2220)  AAC 14.3(  6509)  AGC 10.1(  4626)
AUA 54.3( 24774)  ACA 24.0( 10943)  AAA 47.6( 21739)  AGA 31.2( 14226)
AUG 20.9(  9553)  ACG  4.0(  1811)  AAG 27.3( 12451)  AGG 11.7(  5336)

GUU 32.5( 14841)  GCU 25.8( 11757)  GAU 36.8( 16799)  GGU 20.9(  9550)
GUC  6.1(  2772)  GCC  4.9(  2217)  GAC  9.7(  4442)  GGC  8.9(  4040)
GUA 25.5( 11616)  GCA 23.0( 10491)  GAA 43.5( 19833)  GGA 27.5( 12548)
GUG  7.6(  3484)  GCG  4.5(  2071)  GAG 24.7( 11284)  GGG  7.0(  3212)

Coding GC 36.06% 1st letter GC 45.54% 2nd letter GC 34.27% 3rd letter GC 28.36%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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