Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris DP4 [gbbct]: 3091 CDS's (1048574 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.2(  4433)  UCU  3.3(  3432)  UAU  6.5(  6844)  UGU  2.8(  2957)
UUC 31.8( 33324)  UCC 13.2( 13794)  UAC 16.0( 16814)  UGC 11.6( 12125)
UUA  0.6(   657)  UCA  3.7(  3877)  UAA  0.4(   404)  UGA  1.3(  1414)
UUG  7.2(  7500)  UCG 15.0( 15772)  UAG  1.2(  1279)  UGG 11.8( 12369)

CUU 17.6( 18428)  CCU  6.1(  6414)  CAU  9.7( 10180)  CGU 14.2( 14931)
CUC 37.5( 39320)  CCC 26.0( 27216)  CAC 14.6( 15343)  CGC 36.4( 38152)
CUA  1.7(  1777)  CCA  3.0(  3121)  CAA  4.9(  5127)  CGA  3.7(  3843)
CUG 39.8( 41751)  CCG 16.9( 17761)  CAG 24.4( 25616)  CGG 12.0( 12557)

AUU  4.6(  4866)  ACU  2.7(  2858)  AAU  4.3(  4526)  AGU  3.4(  3546)
AUC 35.1( 36759)  ACC 27.7( 29078)  AAC 19.8( 20763)  AGC 12.6( 13160)
AUA  4.8(  5019)  ACA  6.2(  6464)  AAA  4.7(  4928)  AGA  2.6(  2685)
AUG 27.2( 28478)  ACG 17.9( 18801)  AAG 26.3( 27564)  AGG  6.5(  6802)

GUU  5.0(  5244)  GCU  7.8(  8153)  GAU 12.0( 12545)  GGU 14.2( 14926)
GUC 30.2( 31702)  GCC 60.5( 63402)  GAC 45.5( 47669)  GGC 42.8( 44922)
GUA  5.0(  5235)  GCA 17.0( 17801)  GAA 29.4( 30856)  GGA  9.3(  9793)
GUG 37.9( 39762)  GCG 28.6( 30005)  GAG 29.9( 31372)  GGG 19.4( 20358)

Coding GC 63.55% 1st letter GC 66.31% 2nd letter GC 46.01% 3rd letter GC 78.32%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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