Thermosipho melanesiensis BI429 [gbbct]: 1879 CDS's (584123 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 49.0( 28607)  UCU 14.6(  8535)  UAU 31.3( 18268)  UGU  4.9(  2858)
UUC  8.0(  4656)  UCC  4.5(  2600)  UAC 12.2(  7121)  UGC  1.1(   645)
UUA 39.6( 23143)  UCA 17.0(  9912)  UAA  1.6(   921)  UGA  1.1(   630)
UUG 19.5( 11406)  UCG  3.5(  2032)  UAG  0.6(   328)  UGG  8.4(  4881)

CUU 22.5( 13148)  CCU 10.8(  6328)  CAU  9.7(  5676)  CGU  1.8(  1046)
CUC  3.1(  1835)  CCC  3.0(  1734)  CAC  3.7(  2146)  CGC  0.4(   253)
CUA  9.2(  5357)  CCA 15.7(  9193)  CAA 15.5(  9083)  CGA  1.2(   711)
CUG  2.5(  1460)  CCG  2.7(  1601)  CAG  4.0(  2314)  CGG  0.4(   250)

AUU 45.0( 26298)  ACU 13.5(  7861)  AAU 40.2( 23499)  AGU 14.4(  8438)
AUC  7.6(  4445)  ACC  5.0(  2947)  AAC 15.0(  8743)  AGC  3.9(  2267)
AUA 45.4( 26538)  ACA 21.8( 12756)  AAA 75.5( 44085)  AGA 23.2( 13571)
AUG 20.6( 12058)  ACG  5.0(  2946)  AAG 22.3( 13030)  AGG  9.0(  5234)

GUU 31.5( 18372)  GCU 13.8(  8079)  GAU 42.0( 24545)  GGU 22.0( 12838)
GUC  3.2(  1867)  GCC  4.0(  2358)  GAC  7.7(  4470)  GGC  4.3(  2516)
GUA 25.8( 15052)  GCA 26.5( 15498)  GAA 63.3( 36994)  GGA 27.7( 16164)
GUG  9.6(  5631)  GCG  5.4(  3145)  GAG 15.1(  8794)  GGG  7.5(  4406)
Coding GC 31.23% 1st letter GC 41.58% 2nd letter GC 29.83% 3rd letter GC 22.28%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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