Medicago truncatula [gbpln]: 22674 CDS's (5728832 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 29.2(167404) UCU 23.5(134511) UAU 19.2(109711) UGU 13.0( 74302)
UUC 16.5( 94322) UCC 10.2( 58330) UAC 10.2( 58226) UGC 7.2( 41108)
UUA 16.0( 91625) UCA 21.2(121381) UAA 1.4( 8030) UGA 1.5( 8850)
UUG 25.9(148389) UCG 5.5( 31472) UAG 1.0( 5794) UGG 14.6( 83472)
CUU 25.2(144647) CCU 18.0(103233) CAU 17.6(100920) CGU 7.6( 43544)
CUC 11.1( 63802) CCC 5.5( 31733) CAC 8.3( 47686) CGC 3.7( 20971)
CUA 10.2( 58419) CCA 16.9( 97051) CAA 23.7(135989) CGA 5.3( 30126)
CUG 8.4( 48222) CCG 4.6( 26313) CAG 12.2( 69780) CGG 3.6( 20349)
AUU 29.4(168654) ACU 18.5(105727) AAU 32.2(184695) AGU 15.8( 90493)
AUC 13.7( 78610) ACC 9.8( 56029) AAC 17.9(102797) AGC 8.6( 49391)
AUA 15.5( 88963) ACA 17.9(102711) AAA 35.5(203092) AGA 17.7(101547)
AUG 26.1(149507) ACG 4.2( 24335) AAG 29.7(170139) AGG 12.1( 69288)
GUU 29.5(168814) GCU 24.8(142208) GAU 38.2(218964) GGU 22.1(126695)
GUC 9.0( 51290) GCC 8.2( 47152) GAC 14.3( 81648) GGC 7.9( 45437)
GUA 10.7( 61324) GCA 19.6(112145) GAA 36.5(209151) GGA 21.0(120170)
GUG 16.3( 93097) GCG 4.6( 26542) GAG 25.1(143814) GGG 9.5( 54691)
Coding GC 40.97%
1st letter GC 47.93%
2nd letter GC 38.43%
3rd letter GC 36.55%
List of codon usage for each CDS
[CAUTION: The file is big (> 1000 entries).]
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