Yersinia pestis Pestoides F [gbbct]: 4069 CDS's (1292914 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 22.2( 28765)  UCU  9.9( 12747)  UAU 19.5( 25265)  UGU  5.6(  7190)
UUC 15.5( 20067)  UCC  7.5(  9669)  UAC 10.2( 13136)  UGC  4.8(  6250)
UUA 21.5( 27840)  UCA 10.6( 13702)  UAA  1.8(  2292)  UGA  0.9(  1205)
UUG 23.9( 30891)  UCG  7.1(  9131)  UAG  0.4(   572)  UGG 13.6( 17591)

CUU  9.4( 12144)  CCU 10.0( 12869)  CAU 14.0( 18143)  CGU 20.3( 26197)
CUC  9.0( 11680)  CCC  7.5(  9745)  CAC  8.7( 11215)  CGC 17.0( 22031)
CUA  7.8( 10118)  CCA 12.5( 16129)  CAA 23.7( 30686)  CGA  4.0(  5189)
CUG 36.7( 47419)  CCG 13.6( 17571)  CAG 24.9( 32205)  CGG  7.9( 10265)

AUU 30.6( 39627)  ACU 10.5( 13621)  AAU 24.0( 30985)  AGU 12.8( 16513)
AUC 23.4( 30216)  ACC 21.8( 28250)  AAC 16.8( 21723)  AGC 14.5( 18717)
AUA  7.5(  9702)  ACA  9.5( 12320)  AAA 31.9( 41250)  AGA  3.0(  3882)
AUG 26.3( 33954)  ACG 12.1( 15684)  AAG 12.2( 15710)  AGG  1.9(  2475)

GUU 19.0( 24593)  GCU 19.7( 25527)  GAU 36.8( 47622)  GGU 26.3( 33990)
GUC 15.7( 20274)  GCC 27.3( 35269)  GAC 14.7( 18997)  GGC 23.9( 30848)
GUA 11.1( 14368)  GCA 20.8( 26946)  GAA 34.5( 44607)  GGA  6.1(  7861)
GUG 22.8( 29454)  GCG 24.2( 31240)  GAG 20.6( 26624)  GGG 15.6( 20146)

Coding GC 49.03% 1st letter GC 56.61% 2nd letter GC 40.28% 3rd letter GC 50.20%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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