Clostridium novyi NT [gbbct]: 2325 CDS's (738905 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 36.6( 27069)  UCU 16.3( 12080)  UAU 32.9( 24308)  UGU 10.0(  7357)
UUC  6.0(  4445)  UCC  2.5(  1848)  UAC  7.5(  5571)  UGC  2.6(  1920)
UUA 48.5( 35835)  UCA 17.5( 12896)  UAA  2.2(  1646)  UGA  0.2(   154)
UUG  5.6(  4165)  UCG  1.1(   822)  UAG  0.7(   525)  UGG  6.0(  4448)

CUU 21.7( 16049)  CCU 12.1(  8910)  CAU 10.7(  7934)  CGU  2.2(  1617)
CUC  0.8(   568)  CCC  1.0(   702)  CAC  2.9(  2153)  CGC  0.3(   246)
CUA  9.7(  7152)  CCA 13.8( 10221)  CAA 19.4( 14320)  CGA  0.8(   560)
CUG  0.9(   669)  CCG  1.0(   754)  CAG  3.1(  2284)  CGG  0.1(    86)

AUU 34.7( 25667)  ACU 20.9( 15447)  AAU 53.5( 39538)  AGU 18.1( 13401)
AUC  4.2(  3125)  ACC  2.4(  1766)  AAC 12.2(  8993)  AGC  4.6(  3396)
AUA 61.4( 45350)  ACA 22.5( 16642)  AAA 75.1( 55522)  AGA 26.9( 19843)
AUG 25.7( 18955)  ACG  1.6(  1148)  AAG 24.1( 17775)  AGG  3.1(  2276)

GUU 29.9( 22081)  GCU 23.2( 17155)  GAU 47.4( 35039)  GGU 18.2( 13447)
GUC  1.1(   836)  GCC  3.2(  2387)  GAC  8.0(  5903)  GGC  3.4(  2525)
GUA 30.4( 22473)  GCA 24.9( 18398)  GAA 62.6( 46249)  GGA 36.5( 26984)
GUG  4.9(  3628)  GCG  2.4(  1807)  GAG 11.3(  8371)  GGG  4.7(  3464)

Coding GC 29.20% 1st letter GC 41.27% 2nd letter GC 30.41% 3rd letter GC 15.91%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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