Francisella tularensis subsp. holarctica LVS [gbbct]: 1754 CDS's (520783 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 41.6( 21663) UCU 17.5( 9103) UAU 34.6( 18029) UGU 9.0( 4708)
UUC 8.2( 4293) UCC 1.5( 766) UAC 7.3( 3815) UGC 2.3( 1203)
UUA 39.0( 20328) UCA 19.2( 9980) UAA 2.2( 1137) UGA 0.3( 172)
UUG 11.1( 5806) UCG 3.3( 1710) UAG 0.9( 445) UGG 9.0( 4693)
CUU 20.1( 10487) CCU 12.7( 6613) CAU 14.6( 7585) CGU 6.9( 3594)
CUC 3.0( 1564) CCC 0.8( 424) CAC 3.1( 1634) CGC 2.4( 1229)
CUA 19.5( 10142) CCA 15.2( 7893) CAA 28.3( 14745) CGA 1.9( 988)
CUG 3.2( 1673) CCG 2.1( 1114) CAG 8.6( 4480) CGG 0.3( 143)
AUU 41.7( 21719) ACU 23.4( 12204) AAU 45.6( 23761) AGU 19.0( 9899)
AUC 15.4( 8002) ACC 4.3( 2229) AAC 12.5( 6518) AGC 7.0( 3642)
AUA 36.0( 18750) ACA 20.1( 10484) AAA 59.9( 31198) AGA 18.7( 9733)
AUG 22.5( 11704) ACG 3.1( 1617) AAG 19.5( 10156) AGG 3.2( 1686)
GUU 28.8( 15013) GCU 34.8( 18123) GAU 48.9( 25462) GGU 32.0( 16647)
GUC 6.2( 3240) GCC 4.0( 2083) GAC 6.7( 3489) GGC 8.7( 4522)
GUA 20.7( 10755) GCA 24.4( 12731) GAA 34.5( 17957) GGA 12.3( 6427)
GUG 6.4( 3314) GCG 5.4( 2833) GAG 20.7( 10762) GGG 3.8( 1964)
Coding GC 32.87%
1st letter GC 44.09%
2nd letter GC 32.87%
3rd letter GC 21.65%
List of codon usage for each CDS
[CAUTION: The file is big (> 1000 entries).]
(format)
Homepage