Methanoculleus marisnigri JR1 [gbbct]: 2489 CDS's (722127 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  6.8(  4926)  UCU  2.6(  1854)  UAU  6.0(  4359)  UGU  2.0(  1472)
UUC 29.4( 21266)  UCC 13.6(  9833)  UAC 24.2( 17453)  UGC 11.0(  7912)
UUA  1.8(  1317)  UCA  2.7(  1937)  UAA  0.8(   565)  UGA  2.1(  1513)
UUG  2.7(  1985)  UCG 16.3( 11806)  UAG  0.6(   411)  UGG 10.0(  7231)

CUU 10.3(  7408)  CCU  3.5(  2530)  CAU  4.4(  3188)  CGU  4.7(  3393)
CUC 54.8( 39555)  CCC 17.8( 12883)  CAC 15.2( 10989)  CGC 16.1( 11625)
CUA  1.1(   815)  CCA  2.1(  1523)  CAA  2.1(  1537)  CGA  3.0(  2143)
CUG 23.7( 17080)  CCG 26.3( 19013)  CAG 21.2( 15320)  CGG 33.1( 23883)

AUU  5.4(  3884)  ACU  2.3(  1680)  AAU  4.2(  3010)  AGU  3.0(  2158)
AUC 50.4( 36404)  ACC 27.2( 19670)  AAC 23.0( 16585)  AGC 12.6(  9102)
AUA  5.5(  3950)  ACA  4.0(  2888)  AAA 10.9(  7860)  AGA  4.1(  2959)
AUG 23.7( 17122)  ACG 21.7( 15661)  AAG 22.6( 16312)  AGG  9.0(  6487)

GUU  8.3(  6025)  GCU  5.8(  4196)  GAU 17.8( 12881)  GGU  8.6(  6227)
GUC 47.6( 34395)  GCC 41.3( 29855)  GAC 39.3( 28380)  GGC 34.7( 25041)
GUA  4.4(  3200)  GCA 14.2( 10252)  GAA 20.0( 14452)  GGA 11.4(  8248)
GUG 23.1( 16693)  GCG 40.0( 28918)  GAG 51.5( 37182)  GGG 30.1( 21725)

Coding GC 62.96% 1st letter GC 63.78% 2nd letter GC 43.71% 3rd letter GC 81.40%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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