Sinorhizobium medicae WSM419 [gbbct]: 6227 CDS's (1950050 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  8.6( 16863)  UCU  3.1(  5969)  UAU 12.3( 23910)  UGU  1.5(  2928)
UUC 30.4( 59379)  UCC 14.5( 28245)  UAC 10.7( 20794)  UGC  7.0( 13747)
UUA  0.8(  1543)  UCA  3.3(  6365)  UAA  0.5(   991)  UGA  2.1(  4018)
UUG  8.8( 17202)  UCG 18.9( 36824)  UAG  0.6(  1218)  UGG 13.0( 25389)

CUU 16.3( 31829)  CCU  4.9(  9537)  CAU 10.3( 20026)  CGU  8.6( 16776)
CUC 35.4( 69014)  CCC 12.7( 24859)  CAC 10.1( 19792)  CGC 32.5( 63450)
CUA  2.1(  4037)  CCA  3.9(  7519)  CAA  5.8( 11354)  CGA  5.1(  9848)
CUG 36.5( 71126)  CCG 27.7( 53994)  CAG 23.7( 46176)  CGG 16.2( 31654)

AUU  9.7( 18971)  ACU  3.3(  6466)  AAU 10.2( 19966)  AGU  2.9(  5710)
AUC 41.1( 80170)  ACC 21.6( 42029)  AAC 16.9( 33051)  AGC 14.8( 28913)
AUA  4.2(  8119)  ACA  4.8(  9450)  AAA  8.5( 16550)  AGA  2.7(  5304)
AUG 24.7( 48072)  ACG 21.9( 42746)  AAG 25.8( 50279)  AGG  5.8( 11311)

GUU 10.7( 20780)  GCU 11.5( 22463)  GAU 21.4( 41642)  GGU 12.5( 24284)
GUC 36.3( 70693)  GCC 48.9( 95380)  GAC 33.6( 65463)  GGC 49.5( 96605)
GUA  4.5(  8693)  GCA 16.6( 32401)  GAA 26.1( 50971)  GGA 10.4( 20269)
GUG 22.6( 44007)  GCG 42.8( 83444)  GAG 33.8( 65857)  GGG 12.1( 23615)

Coding GC 61.77% 1st letter GC 64.49% 2nd letter GC 45.72% 3rd letter GC 75.10%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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