Polaromonas naphthalenivorans CJ2 [gbbct]: 4951 CDS's (1586862 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 15.3( 24243)  UCU  2.6(  4115)  UAU  7.0( 11171)  UGU  1.2(  1973)
UUC 20.5( 32575)  UCC  9.9( 15778)  UAC 15.2( 24173)  UGC  9.0( 14226)
UUA  1.5(  2332)  UCA  4.2(  6647)  UAA  0.8(  1226)  UGA  2.0(  3149)
UUG 13.0( 20600)  UCG 15.3( 24332)  UAG  0.4(   576)  UGG 14.2( 22609)

CUU  7.3( 11513)  CCU  5.5(  8697)  CAU  9.1( 14402)  CGU  5.8(  9236)
CUC 15.6( 24728)  CCC 17.1( 27083)  CAC 13.3( 21135)  CGC 38.1( 60407)
CUA  1.6(  2466)  CCA  4.6(  7295)  CAA 10.0( 15869)  CGA  2.8(  4439)
CUG 68.7(109075)  CCG 24.1( 38227)  CAG 32.1( 50923)  CGG 12.9( 20484)

AUU 13.9( 22028)  ACU  3.4(  5349)  AAU  8.2( 13018)  AGU  3.3(  5278)
AUC 29.6( 47002)  ACC 26.9( 42676)  AAC 20.4( 32342)  AGC 22.7( 35979)
AUA  2.0(  3184)  ACA  3.6(  5740)  AAA 13.2( 20969)  AGA  1.4(  2281)
AUG 25.1( 39779)  ACG 17.4( 27556)  AAG 26.0( 41211)  AGG  3.4(  5359)

GUU  7.7( 12211)  GCU 10.3( 16300)  GAU 15.2( 24056)  GGU  7.9( 12567)
GUC 24.6( 39031)  GCC 61.6( 97692)  GAC 35.2( 55850)  GGC 58.1( 92120)
GUA  2.8(  4450)  GCA 11.9( 18920)  GAA 27.8( 44136)  GGA  5.4(  8538)
GUG 37.5( 59468)  GCG 39.7( 62939)  GAG 25.0( 39729)  GGG  8.4( 13400)

Coding GC 62.76% 1st letter GC 64.74% 2nd letter GC 45.46% 3rd letter GC 78.08%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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