Plasmodium falciparum 3D7 [gbinv]: 4023 CDS's (2993721 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 36.3(108597)  UCU 14.7( 44072)  UAU 50.5(151275)  UGU 15.2( 45631)
UUC  7.1( 21216)  UCC  5.1( 15184)  UAC  6.1( 18277)  UGC  2.3(  6813)
UUA 47.3(141467)  UCA 16.6( 49689)  UAA  0.9(  2762)  UGA  0.3(   856)
UUG 10.4( 31055)  UCG  3.0(  8892)  UAG  0.1(   405)  UGG  4.9( 14622)

CUU  8.7( 25901)  CCU  7.9( 23687)  CAU 20.7( 62098)  CGU  3.0(  8929)
CUC  1.8(  5366)  CCC  2.0(  6084)  CAC  3.4( 10323)  CGC  0.4(  1260)
CUA  6.0( 18000)  CCA  9.1( 27384)  CAA 24.2( 72417)  CGA  2.4(  7156)
CUG  1.4(  4324)  CCG  0.9(  2802)  CAG  3.7( 11054)  CGG  0.3(   818)

AUU 35.9(107358)  ACU 10.6( 31753)  AAU123.5(369612)  AGU 20.3( 60737)
AUC  6.3( 18786)  ACC  4.8( 14295)  AAC 20.0( 59914)  AGC  3.9( 11811)
AUA 50.0(149610)  ACA 21.6( 64810)  AAA 95.7(286523)  AGA 15.9( 47461)
AUG 21.9( 65616)  ACG  3.7( 11222)  AAG 21.4( 64080)  AGG  4.3( 12856)

GUU 15.5( 46418)  GCU  8.2( 24686)  GAU 55.6(166598)  GGU 11.9( 35530)
GUC  2.4(  7210)  GCC  2.1(  6234)  GAC  8.6( 25791)  GGC  1.3(  3899)
GUA 15.9( 47599)  GCA  8.4( 25235)  GAA 61.8(184975)  GGA 12.6( 37635)
GUG  4.8( 14416)  GCG  1.0(  3143)  GAG 10.4( 31177)  GGG  2.8(  8315)

Coding GC 23.80% 1st letter GC 31.95% 2nd letter GC 22.16% 3rd letter GC 17.28%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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