Helicobacter pylori HPAG1 [gbbct]: 1544 CDS's (491081 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 42.4( 20839)  UCU 15.9(  7816)  UAU 25.6( 12580)  UGU  3.5(  1707)
UUC 11.5(  5644)  UCC  5.5(  2708)  UAC 11.2(  5514)  UGC  7.4(  3621)
UUA 43.7( 21450)  UCA  6.1(  2985)  UAA  1.8(   868)  UGA  0.8(   417)
UUG 29.9( 14674)  UCG  3.8(  1871)  UAG  0.5(   259)  UGG  7.1(  3466)

CUU 16.6(  8131)  CCU 16.2(  7975)  CAU 14.6(  7184)  CGU  4.9(  2394)
CUC  9.9(  4848)  CCC  8.7(  4273)  CAC  6.6(  3257)  CGC  8.6(  4206)
CUA  8.0(  3931)  CCA  4.8(  2349)  CAA 31.3( 15352)  CGA  2.5(  1205)
CUG  4.2(  2078)  CCG  3.3(  1601)  CAG  5.5(  2708)  CGG  1.0(   514)

AUU 35.4( 17377)  ACU 13.3(  6547)  AAU 32.7( 16081)  AGU  9.5(  4656)
AUC 27.2( 13376)  ACC 13.9(  6823)  AAC 25.4( 12480)  AGC 27.0( 13249)
AUA  9.0(  4432)  ACA  6.9(  3402)  AAA 68.4( 33575)  AGA  8.9(  4359)
AUG 22.2( 10909)  ACG  9.7(  4775)  AAG 20.2(  9905)  AGG  8.4(  4102)

GUU 15.3(  7518)  GCU 27.1( 13289)  GAU 34.1( 16749)  GGU  9.4(  4629)
GUC  7.8(  3807)  GCC 14.0(  6852)  GAC 12.7(  6257)  GGC 20.8( 10223)
GUA  5.8(  2851)  GCA  7.4(  3627)  GAA 50.4( 24727)  GGA  6.2(  3037)
GUG 27.5( 13486)  GCG 20.4( 10016)  GAG 17.8(  8743)  GGG 22.0( 10797)

Coding GC 39.72% 1st letter GC 44.52% 2nd letter GC 32.48% 3rd letter GC 42.16%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage