Orientia tsutsugamushi Boryong [gbbct]: 1182 CDS's (346074 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 38.4( 13285)  UCU 20.2(  6994)  UAU 32.8( 11352)  UGU 10.0(  3457)
UUC  5.3(  1822)  UCC  2.0(   687)  UAC  7.5(  2604)  UGC  4.8(  1652)
UUA 48.9( 16912)  UCA 18.6(  6432)  UAA  2.1(   724)  UGA  0.6(   219)
UUG 13.4(  4630)  UCG  2.4(   834)  UAG  0.7(   239)  UGG  7.7(  2673)

CUU 16.2(  5612)  CCU 11.9(  4120)  CAU 17.4(  6026)  CGU  5.8(  1998)
CUC  2.1(   720)  CCC  0.5(   189)  CAC  3.7(  1285)  CGC  1.7(   604)
CUA 16.7(  5791)  CCA 14.2(  4899)  CAA 30.1( 10400)  CGA  3.4(  1184)
CUG  4.4(  1538)  CCG  1.5(   516)  CAG 10.3(  3572)  CGG  0.8(   270)

AUU 50.8( 17584)  ACU 26.0(  9009)  AAU 56.6( 19584)  AGU 20.1(  6967)
AUC  8.8(  3035)  ACC  3.4(  1166)  AAC 13.5(  4676)  AGC 10.9(  3775)
AUA 41.2( 14246)  ACA 19.2(  6658)  AAA 58.7( 20318)  AGA 16.7(  5770)
AUG 21.2(  7349)  ACG  2.2(   761)  AAG 21.7(  7504)  AGG  5.0(  1738)

GUU 24.7(  8553)  GCU 31.9( 11044)  GAU 41.9( 14503)  GGU 16.1(  5560)
GUC  3.1(  1059)  GCC  2.6(   915)  GAC  6.9(  2403)  GGC  6.5(  2254)
GUA 24.0(  8307)  GCA 22.7(  7869)  GAA 41.3( 14287)  GGA 19.8(  6846)
GUG  5.1(  1781)  GCG  2.8(   952)  GAG 13.8(  4792)  GGG  4.5(  1569)

Coding GC 30.88% 1st letter GC 40.86% 2nd letter GC 31.66% 3rd letter GC 20.10%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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