Mycobacterium flavescens PYR-GCK [gbbct]: 5581 CDS's (1834288 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  1.6(  3024)  UCU  1.6(  2860)  UAU  3.6(  6630)  UGU  1.5(  2795)
UUC 28.5( 52277)  UCC 13.1( 24018)  UAC 17.3( 31817)  UGC  6.6( 12126)
UUA  0.5(   845)  UCA  2.5(  4661)  UAA  0.2(   442)  UGA  2.0(  3735)
UUG  8.6( 15687)  UCG 21.0( 38576)  UAG  0.8(  1404)  UGG 15.2( 27790)

CUU  3.3(  6043)  CCU  2.8(  5051)  CAU  4.3(  7801)  CGU  7.7( 14142)
CUC 28.6( 52495)  CCC 19.6( 35888)  CAC 17.7( 32452)  CGC 33.5( 61471)
CUA  1.3(  2343)  CCA  2.6(  4819)  CAA  3.6(  6636)  CGA  5.0(  9155)
CUG 54.1( 99301)  CCG 33.4( 61304)  CAG 25.0( 45830)  CGG 22.9( 41972)

AUU  2.2(  4066)  ACU  2.2(  4084)  AAU  2.9(  5305)  AGU  2.8(  5180)
AUC 38.6( 70817)  ACC 36.9( 67683)  AAC 18.6( 34074)  AGC 13.3( 24389)
AUA  0.8(  1434)  ACA  3.6(  6630)  AAA  3.5(  6472)  AGA  1.2(  2235)
AUG 19.4( 35648)  ACG 19.3( 35396)  AAG 17.3( 31821)  AGG  3.6(  6634)

GUU  3.6(  6663)  GCU  6.0( 11067)  GAU 12.3( 22627)  GGU 14.9( 27245)
GUC 43.7( 80088)  GCC 59.0(108229)  GAC 52.7( 96579)  GGC 46.3( 84893)
GUA  2.1(  3904)  GCA 10.1( 18575)  GAA 13.9( 25581)  GGA 10.0( 18383)
GUG 39.0( 71570)  GCG 54.1( 99173)  GAG 39.0( 71466)  GGG 16.9( 30987)

Coding GC 68.12% 1st letter GC 68.90% 2nd letter GC 49.13% 3rd letter GC 86.35%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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