Rhizobium etli CFN 42 [gbbct]: 5627 CDS's (1772051 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  8.6( 15155)  UCU  2.7(  4719)  UAU 13.7( 24232)  UGU  1.3(  2290)
UUC 30.7( 54437)  UCC 14.0( 24828)  UAC  9.7( 17211)  UGC  6.9( 12304)
UUA  0.8(  1380)  UCA  3.4(  6002)  UAA  0.7(  1162)  UGA  2.0(  3535)
UUG  7.9( 14083)  UCG 20.0( 35373)  UAG  0.5(   930)  UGG 12.9( 22910)

CUU 13.8( 24477)  CCU  4.6(  8102)  CAU 11.4( 20233)  CGU  7.8( 13817)
CUC 33.3( 58975)  CCC 12.4( 21996)  CAC  9.1( 16138)  CGC 35.3( 62544)
CUA  1.7(  3097)  CCA  3.3(  5764)  CAA  5.3(  9381)  CGA  4.0(  7028)
CUG 41.6( 73802)  CCG 28.5( 50515)  CAG 25.5( 45115)  CGG 14.1( 25002)

AUU  9.3( 16482)  ACU  3.0(  5299)  AAU 11.6( 20477)  AGU  2.5(  4380)
AUC 45.5( 80597)  ACC 24.0( 42604)  AAC 16.9( 30013)  AGC 15.8( 27974)
AUA  2.5(  4435)  ACA  4.3(  7694)  AAA  8.8( 15668)  AGA  2.3(  4132)
AUG 24.9( 44089)  ACG 20.7( 36717)  AAG 27.9( 49399)  AGG  4.9(  8711)

GUU  8.9( 15759)  GCU 10.3( 18238)  GAU 24.4( 43229)  GGU 10.7( 18915)
GUC 39.2( 69492)  GCC 57.0(101082)  GAC 31.9( 56591)  GGC 55.9( 99066)
GUA  2.6(  4582)  GCA 12.8( 22705)  GAA 27.0( 47798)  GGA  7.0( 12453)
GUG 21.2( 37503)  GCG 38.9( 68935)  GAG 30.9( 54753)  GGG  8.9( 15742)

Coding GC 61.96% 1st letter GC 63.93% 2nd letter GC 45.22% 3rd letter GC 76.72%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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