Vibrio cholerae O395 [gbbct]: 3899 CDS's (1223080 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.3( 32218)  UCU 11.1( 13563)  UAU 15.7( 19191)  UGU  5.9(  7185)
UUC 13.8( 16932)  UCC  6.0(  7310)  UAC 13.8( 16926)  UGC  4.5(  5456)
UUA 19.7( 24123)  UCA 10.6( 12909)  UAA  2.0(  2422)  UGA  0.7(   814)
UUG 23.3( 28451)  UCG  9.3( 11316)  UAG  0.5(   663)  UGG 13.3( 16209)

CUU 12.7( 15514)  CCU 11.2( 13661)  CAU 12.9( 15748)  CGU 19.7( 24142)
CUC 14.9( 18204)  CCC  6.0(  7320)  CAC 10.8( 13204)  CGC 17.8( 21794)
CUA  8.8( 10781)  CCA 12.3( 15055)  CAA 33.6( 41044)  CGA  5.1(  6223)
CUG 28.6( 35028)  CCG 10.8( 13162)  CAG 18.1( 22151)  CGG  2.8(  3376)

AUU 30.8( 37669)  ACU 12.8( 15628)  AAU 19.4( 23688)  AGU 11.8( 14406)
AUC 25.1( 30715)  ACC 20.3( 24874)  AAC 19.6( 23936)  AGC 14.2( 17356)
AUA  4.0(  4880)  ACA  7.8(  9542)  AAA 35.8( 43731)  AGA  2.8(  3451)
AUG 26.2( 32011)  ACG 11.1( 13563)  AAG 13.5( 16553)  AGG  1.1(  1327)

GUU 16.0( 19521)  GCU 20.0( 24441)  GAU 36.6( 44797)  GGU 25.8( 31566)
GUC 14.3( 17530)  GCC 21.9( 26841)  GAC 13.9( 16982)  GGC 24.4( 29868)
GUA 10.9( 13349)  GCA 19.0( 23288)  GAA 38.2( 46676)  GGA  7.7(  9478)
GUG 29.2( 35694)  GCG 30.6( 37484)  GAG 24.1( 29443)  GGG  8.7( 10697)

Coding GC 48.23% 1st letter GC 56.75% 2nd letter GC 38.70% 3rd letter GC 49.25%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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