Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 [gbbct]: 1542 CDS's (498161 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.7( 13325)  UCU 14.7(  7312)  UAU 33.9( 16880)  UGU 11.2(  5561)
UUC  8.8(  4368)  UCC  3.8(  1888)  UAC  9.2(  4601)  UGC  0.6(   278)
UUA 44.0( 21942)  UCA 22.6( 11236)  UAA  2.2(  1096)  UGA  0.3(   165)
UUG  4.4(  2189)  UCG  0.4(   181)  UAG  0.6(   281)  UGG  5.5(  2742)

CUU 19.0(  9475)  CCU 11.5(  5729)  CAU 14.0(  6990)  CGU  5.8(  2911)
CUC  2.3(  1135)  CCC  1.4(   682)  CAC  2.9(  1424)  CGC  0.2(   114)
CUA 12.8(  6385)  CCA 18.4(  9175)  CAA 21.9( 10923)  CGA  1.4(   712)
CUG  1.1(   553)  CCG  0.3(   164)  CAG  3.9(  1919)  CGG  0.2(    76)

AUU 44.9( 22362)  ACU 20.3( 10126)  AAU 59.1( 29424)  AGU 19.7(  9806)
AUC  7.1(  3518)  ACC  4.0(  1987)  AAC 15.6(  7775)  AGC  1.3(   654)
AUA 50.6( 25205)  ACA 42.0( 20943)  AAA 70.0( 34872)  AGA 20.1(  9989)
AUG 22.3( 11127)  ACG  0.8(   377)  AAG 11.2(  5585)  AGG  2.5(  1231)

GUU 25.2( 12565)  GCU 17.3(  8615)  GAU 53.4( 26606)  GGU 25.9( 12887)
GUC  1.2(   614)  GCC  1.7(   869)  GAC  7.3(  3624)  GGC  1.4(   696)
GUA 32.1( 16007)  GCA 32.5( 16198)  GAA 61.4( 30608)  GGA 30.3( 15106)
GUG  4.5(  2225)  GCG  0.3(   129)  GAG  6.4(  3187)  GGG  1.7(   832)

Coding GC 29.14% 1st letter GC 41.98% 2nd letter GC 31.99% 3rd letter GC 13.45%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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