Syntrophobacter fumaroxidans MPOB [gbbct]: 4064 CDS's (1367870 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 11.3( 15397)  UCU  2.9(  3945)  UAU  8.6( 11828)  UGU  3.0(  4086)
UUC 30.0( 41070)  UCC 18.3( 25006)  UAC 18.3( 24977)  UGC 10.7( 14691)
UUA  0.7(  1006)  UCA  3.0(  4087)  UAA  0.4(   502)  UGA  1.8(  2515)
UUG 12.0( 16419)  UCG 14.2( 19457)  UAG  0.8(  1047)  UGG 12.0( 16468)

CUU 12.2( 16653)  CCU  5.5(  7586)  CAU  7.6( 10434)  CGU  6.4(  8795)
CUC 31.4( 42974)  CCC 20.4( 27878)  CAC 13.6( 18671)  CGC 21.3( 29089)
CUA  0.9(  1232)  CCA  2.3(  3092)  CAA  6.4(  8822)  CGA  6.6(  9066)
CUG 44.4( 60733)  CCG 22.4( 30579)  CAG 22.8( 31156)  CGG 23.3( 31875)

AUU 11.0( 15024)  ACU  3.9(  5326)  AAU  8.2( 11247)  AGU  3.4(  4674)
AUC 39.5( 54058)  ACC 23.6( 32314)  AAC 20.5( 28065)  AGC 15.2( 20854)
AUA  4.4(  6040)  ACA  3.3(  4467)  AAA 14.1( 19346)  AGA  5.3(  7249)
AUG 24.3( 33288)  ACG 17.7( 24239)  AAG 28.5( 39035)  AGG 11.9( 16254)

GUU 11.3( 15406)  GCU  8.2( 11213)  GAU 18.7( 25610)  GGU  9.6( 13098)
GUC 29.2( 39990)  GCC 43.2( 59111)  GAC 33.0( 45153)  GGC 32.7( 44688)
GUA  3.4(  4589)  GCA  9.3( 12699)  GAA 33.6( 45957)  GGA 17.4( 23793)
GUG 32.4( 44269)  GCG 32.3( 44219)  GAG 32.4( 44276)  GGG 22.8( 31183)

Coding GC 60.20% 1st letter GC 61.69% 2nd letter GC 43.40% 3rd letter GC 75.53%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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