Adult diarrheal rotavirus strain J19 [gbvrl]: 11 CDS's (5690 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 34.8(   198)  UCU 21.6(   123)  UAU 29.0(   165)  UGU  9.5(    54)
UUC 10.5(    60)  UCC  4.7(    27)  UAC 10.5(    60)  UGC  2.8(    16)
UUA 38.1(   217)  UCA 34.4(   196)  UAA  0.7(     4)  UGA  0.7(     4)
UUG 15.1(    86)  UCG  3.9(    22)  UAG  0.5(     3)  UGG  7.7(    44)

CUU 11.8(    67)  CCU  8.6(    49)  CAU 14.8(    84)  CGU  4.7(    27)
CUC  3.7(    21)  CCC  2.1(    12)  CAC  3.7(    21)  CGC  1.8(    10)
CUA 12.0(    68)  CCA 22.7(   129)  CAA 29.9(   170)  CGA  3.9(    22)
CUG  6.5(    37)  CCG  3.0(    17)  CAG  9.3(    53)  CGG  1.1(     6)

AUU 42.4(   241)  ACU 24.8(   141)  AAU 50.1(   285)  AGU 10.5(    60)
AUC  9.7(    55)  ACC  4.9(    28)  AAC 16.2(    92)  AGC  4.0(    23)
AUA 29.9(   170)  ACA 25.7(   146)  AAA 56.4(   321)  AGA 34.6(   197)
AUG 27.9(   159)  ACG  7.4(    42)  AAG 12.7(    72)  AGG  3.9(    22)

GUU 29.2(   166)  GCU 24.4(   139)  GAU 48.5(   276)  GGU 13.4(    76)
GUC  5.3(    30)  GCC  6.0(    34)  GAC 12.3(    70)  GGC  3.3(    19)
GUA 14.1(    80)  GCA 22.0(   125)  GAA 42.5(   242)  GGA 20.9(   119)
GUG 10.4(    59)  GCG  5.1(    29)  GAG 16.0(    91)  GGG  1.6(     9)
Coding GC 33.12% 1st letter GC 41.42% 2nd letter GC 34.57% 3rd letter GC 23.36%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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