Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 [gbbct]: 3497 CDS's (1123140 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 39.1( 43891)  UCU 10.2( 11401)  UAU 18.6( 20910)  UGU  6.0(  6764)
UUC  3.8(  4263)  UCC  1.2(  1380)  UAC 13.0( 14623)  UGC  3.9(  4387)
UUA 47.9( 53809)  UCA 12.8( 14397)  UAA  2.3(  2627)  UGA  0.3(   344)
UUG 10.3( 11579)  UCG  8.6(  9674)  UAG  0.5(   526)  UGG 11.0( 12308)

CUU 18.6( 20928)  CCU 12.2( 13650)  CAU 13.6( 15323)  CGU 15.9( 17901)
CUC  5.2(  5811)  CCC  4.1(  4628)  CAC  8.3(  9301)  CGC 13.8( 15456)
CUA 13.9( 15639)  CCA 14.0( 15777)  CAA 35.7( 40052)  CGA  3.5(  3912)
CUG  8.9(  9944)  CCG  6.2(  6970)  CAG 12.4( 13927)  CGG  1.3(  1438)

AUU 42.2( 47419)  ACU 17.0( 19077)  AAU 28.7( 32236)  AGU 16.3( 18258)
AUC  6.8(  7601)  ACC 16.4( 18366)  AAC 21.1( 23685)  AGC 17.0( 19043)
AUA 18.4( 20621)  ACA 14.4( 16192)  AAA 45.9( 51588)  AGA  3.8(  4234)
AUG 23.3( 26167)  ACG  7.6(  8583)  AAG 12.4( 13909)  AGG  1.4(  1598)

GUU 23.3( 26157)  GCU 25.2( 28331)  GAU 36.7( 41204)  GGU 27.4( 30789)
GUC  2.6(  2866)  GCC 17.0( 19099)  GAC 17.0( 19099)  GGC 24.7( 27732)
GUA 26.7( 29969)  GCA 31.0( 34797)  GAA 36.5( 40949)  GGA  5.0(  5570)
GUG 14.0( 15668)  GCG 16.1( 18032)  GAG 20.4( 22888)  GGG  7.0(  7873)

Coding GC 40.90% 1st letter GC 51.79% 2nd letter GC 37.21% 3rd letter GC 33.69%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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