Shewanella loihica PV-4 [gbbct]: 3859 CDS's (1315100 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 17.0( 22325)  UCU  8.8( 11587)  UAU 17.0( 22407)  UGU  5.1(  6759)
UUC 21.3( 28003)  UCC  7.1(  9303)  UAC 13.2( 17357)  UGC  5.3(  7016)
UUA  7.9( 10387)  UCA  6.1(  7995)  UAA  1.7(  2194)  UGA  0.4(   579)
UUG 12.3( 16151)  UCG 10.1( 13265)  UAG  0.8(  1086)  UGG 12.1( 15892)

CUU  9.6( 12640)  CCU  9.5( 12502)  CAU 11.0( 14502)  CGU 13.6( 17840)
CUC 19.9( 26178)  CCC 12.7( 16688)  CAC 11.3( 14830)  CGC 19.8( 26013)
CUA  9.1( 12003)  CCA  8.2( 10807)  CAA 13.6( 17875)  CGA  2.7(  3606)
CUG 50.8( 66825)  CCG 10.3( 13575)  CAG 35.5( 46708)  CGG  3.6(  4791)

AUU 11.5( 15139)  ACU  7.4(  9723)  AAU 12.8( 16780)  AGU  8.3( 10857)
AUC 37.5( 49264)  ACC 28.7( 37680)  AAC 24.0( 31504)  AGC 23.8( 31244)
AUA  8.5( 11145)  ACA  6.6(  8632)  AAA 14.6( 19208)  AGA  4.3(  5608)
AUG 25.8( 33963)  ACG  7.7( 10069)  AAG 34.0( 44704)  AGG  3.7(  4829)

GUU  9.3( 12249)  GCU 10.6( 13881)  GAU 31.0( 40785)  GGU 20.2( 26576)
GUC 17.6( 23201)  GCC 52.0( 68412)  GAC 24.9( 32724)  GGC 38.6( 50713)
GUA  8.7( 11476)  GCA 10.6( 13902)  GAA 21.1( 27811)  GGA  4.8(  6369)
GUG 31.7( 41650)  GCG 23.8( 31310)  GAG 39.8( 52301)  GGG  8.9( 11702)

Coding GC 55.28% 1st letter GC 59.50% 2nd letter GC 39.52% 3rd letter GC 66.84%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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