Rubus idaeus [gbpln]: 16 CDS's (6369 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 13.5(    86)  UCU 10.8(    69)  UAU  4.2(    27)  UGU  7.9(    50)
UUC 23.7(   151)  UCC 18.7(   119)  UAC 19.2(   122)  UGC 12.2(    78)
UUA  6.3(    40)  UCA 10.7(    68)  UAA  0.9(     6)  UGA  1.3(     8)
UUG 29.4(   187)  UCG  7.5(    48)  UAG  0.3(     2)  UGG  7.2(    46)

CUU 19.6(   125)  CCU 16.3(   104)  CAU  7.1(    45)  CGU  5.7(    36)
CUC 29.8(   190)  CCC 16.0(   102)  CAC 16.2(   103)  CGC  7.1(    45)
CUA  8.9(    57)  CCA  9.3(    59)  CAA 17.1(   109)  CGA  2.0(    13)
CUG 13.5(    86)  CCG 11.6(    74)  CAG 15.4(    98)  CGG  2.8(    18)

AUU 24.0(   153)  ACU 18.4(   117)  AAU 11.6(    74)  AGU 10.2(    65)
AUC 27.8(   177)  ACC 23.9(   152)  AAC 29.2(   186)  AGC 11.3(    72)
AUA  6.0(    38)  ACA 11.3(    72)  AAA 20.9(   133)  AGA  7.1(    45)
AUG 23.1(   147)  ACG  7.4(    47)  AAG 44.9(   286)  AGG 12.9(    82)

GUU 20.7(   132)  GCU 22.9(   146)  GAU 15.5(    99)  GGU 21.0(   134)
GUC 23.6(   150)  GCC 27.9(   178)  GAC 35.5(   226)  GGC 18.7(   119)
GUA  4.4(    28)  GCA 18.5(   118)  GAA 22.6(   144)  GGA 12.7(    81)
GUG 22.9(   146)  GCG  8.6(    55)  GAG 41.5(   264)  GGG 20.7(   132)

Coding GC 51.58% 1st letter GC 53.63% 2nd letter GC 40.07% 3rd letter GC 61.05%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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