Pichia stipitis CBS 6054 [gbpln]: 3857 CDS's (1917388 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.5( 37436)  UCU 23.4( 44892)  UAU 14.5( 27806)  UGU  7.0( 13408)
UUC 25.7( 49198)  UCC 14.6( 28000)  UAC 20.8( 39805)  UGC  3.1(  5992)
UUA 14.6( 28010)  UCA 13.9( 26655)  UAA  0.7(  1365)  UGA  0.4(   806)
UUG 46.2( 88588)  UCG 13.2( 25217)  UAG  0.9(  1686)  UGG 10.3( 19688)

CUU 15.9( 30449)  CCU 15.2( 29151)  CAU 11.4( 21784)  CGU  6.5( 12542)
CUC 11.1( 21307)  CCC  7.7( 14787)  CAC  9.9( 18903)  CGC  2.0(  3845)
CUA  5.8( 11168)  CCA 16.9( 32351)  CAA 19.7( 37858)  CGA  3.2(  6071)
CUG  5.2(  9929)  CCG  4.3(  8150)  CAG 18.5( 35412)  CGG  1.9(  3588)

AUU 26.2( 50146)  ACU 20.6( 39555)  AAU 24.8( 47635)  AGU 12.2( 23303)
AUC 26.9( 51631)  ACC 15.4( 29474)  AAC 31.8( 61018)  AGC  9.8( 18705)
AUA 12.7( 24378)  ACA 14.2( 27263)  AAA 25.9( 49591)  AGA 24.2( 46375)
AUG 17.9( 34228)  ACG  7.1( 13526)  AAG 42.6( 81597)  AGG  4.5(  8679)

GUU 19.7( 37769)  GCU 25.5( 48823)  GAU 30.5( 58542)  GGU 21.1( 40515)
GUC 15.3( 29428)  GCC 17.2( 32893)  GAC 28.6( 54883)  GGC 11.0( 21126)
GUA 13.4( 25711)  GCA 13.1( 25097)  GAA 44.8( 85900)  GGA 16.4( 31396)
GUG 13.0( 24861)  GCG  3.7(  7073)  GAG 21.8( 41878)  GGG  4.5(  8542)

Coding GC 42.82% 1st letter GC 45.46% 2nd letter GC 36.38% 3rd letter GC 46.61%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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