Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13) [gbbct]: 2862 CDS's (866779 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.7( 17948)  UCU  8.5(  7331)  UAU  9.0(  7787)  UGU  4.2(  3607)
UUC 13.8( 11957)  UCC 15.5( 13404)  UAC 16.9( 14686)  UGC  6.7(  5774)
UUA  3.0(  2561)  UCA  2.7(  2368)  UAA  0.7(   577)  UGA  1.3(  1111)
UUG 32.8( 28433)  UCG  7.4(  6439)  UAG  1.4(  1174)  UGG 17.9( 15548)

CUU  7.9(  6881)  CCU 11.7( 10172)  CAU  7.3(  6355)  CGU  7.1(  6149)
CUC 19.1( 16546)  CCC 27.1( 23455)  CAC 12.8( 11135)  CGC 29.6( 25626)
CUA  6.4(  5514)  CCA  7.0(  6075)  CAA 23.0( 19943)  CGA  6.5(  5599)
CUG 54.5( 47281)  CCG 15.9( 13783)  CAG 34.6( 29952)  CGG 21.6( 18692)

AUU 17.2( 14922)  ACU  6.7(  5785)  AAU  7.5(  6501)  AGU  4.6(  4030)
AUC 29.2( 25296)  ACC 26.3( 22791)  AAC 17.8( 15387)  AGC 18.4( 15920)
AUA  1.6(  1387)  ACA  4.3(  3720)  AAA 12.3( 10638)  AGA  2.8(  2422)
AUG 16.5( 14284)  ACG  9.0(  7836)  AAG 16.9( 14660)  AGG  4.0(  3440)

GUU 11.1(  9595)  GCU 20.0( 17349)  GAU 26.7( 23106)  GGU  7.9(  6883)
GUC 13.2( 11407)  GCC 49.2( 42661)  GAC 16.9( 14670)  GGC 30.8( 26674)
GUA  5.5(  4794)  GCA 11.3(  9822)  GAA 24.7( 21434)  GGA 13.0( 11274)
GUG 39.6( 34282)  GCG 17.1( 14864)  GAG 37.8( 32804)  GGG 25.7( 22278)

Coding GC 59.34% 1st letter GC 64.27% 2nd letter GC 44.17% 3rd letter GC 69.58%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage