Synechococcus sp. WH 7803 [gbbct]: 2543 CDS's (738989 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 10.3(  7579)  UCU  5.1(  3758)  UAU  6.3(  4664)  UGU  3.4(  2493)
UUC 20.7( 15329)  UCC 13.9( 10242)  UAC 11.6(  8593)  UGC  8.8(  6523)
UUA  2.2(  1656)  UCA  6.3(  4644)  UAA  0.5(   366)  UGA  2.7(  1979)
UUG 18.5( 13641)  UCG  9.2(  6829)  UAG  0.3(   198)  UGG 17.6( 13014)

CUU 15.8( 11706)  CCU 10.5(  7743)  CAU  9.2(  6833)  CGU 12.6(  9308)
CUC 33.0( 24378)  CCC 20.9( 15447)  CAC 11.8(  8742)  CGC 32.0( 23628)
CUA  2.0(  1470)  CCA  8.7(  6402)  CAA 13.8( 10202)  CGA  6.6(  4888)
CUG 54.1( 39962)  CCG 15.3( 11292)  CAG 33.3( 24636)  CGG 14.0( 10324)

AUU 11.5(  8518)  ACU  4.2(  3092)  AAU 10.0(  7386)  AGU  8.2(  6027)
AUC 30.0( 22169)  ACC 25.2( 18596)  AAC 16.2( 11998)  AGC 22.1( 16326)
AUA  0.6(   464)  ACA  6.6(  4860)  AAA  9.6(  7094)  AGA  2.6(  1948)
AUG 19.6( 14511)  ACG 12.6(  9328)  AAG 15.4( 11349)  AGG  4.6(  3403)

GUU 13.6( 10073)  GCU 20.4( 15067)  GAU 29.4( 21709)  GGU 18.7( 13808)
GUC 12.0(  8866)  GCC 47.7( 35250)  GAC 24.7( 18286)  GGC 33.9( 25068)
GUA  1.5(  1094)  GCA 14.2( 10493)  GAA 24.6( 18187)  GGA 15.5( 11480)
GUG 44.2( 32678)  GCG 23.6( 17434)  GAG 31.3( 23138)  GGG 14.6( 10820)

Coding GC 60.62% 1st letter GC 66.36% 2nd letter GC 46.21% 3rd letter GC 69.28%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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