Deinococcus geothermalis DSM 11300 [gbbct]: 5714 CDS's (1828482 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 12.2( 22268)  UCU  2.3(  4132)  UAU  5.5( 10108)  UGU  1.4(  2592)
UUC 19.3( 35218)  UCC  7.7( 14124)  UAC 17.7( 32398)  UGC  4.6(  8338)
UUA  0.5(   912)  UCA  1.9(  3472)  UAA  0.6(  1182)  UGA  1.9(  3488)
UUG  9.4( 17110)  UCG  7.7( 14078)  UAG  0.6(  1044)  UGG 13.7( 25058)

CUU  6.4( 11724)  CCU  5.8( 10676)  CAU  5.2(  9596)  CGU  8.3( 15090)
CUC 30.7( 56110)  CCC 27.4( 50104)  CAC 16.2( 29570)  CGC 40.0( 73084)
CUA  2.0(  3686)  CCA  4.5(  8262)  CAA  6.1( 11080)  CGA  3.3(  6026)
CUG 71.9(131498)  CCG 22.2( 40518)  CAG 31.8( 58060)  CGG 23.3( 42532)

AUU  8.1( 14844)  ACU  3.3(  5972)  AAU  5.7( 10354)  AGU  5.3(  9616)
AUC 25.4( 46452)  ACC 32.9( 60208)  AAC 18.5( 33778)  AGC 21.6( 39484)
AUA  0.4(   774)  ACA  4.0(  7324)  AAA  5.2(  9448)  AGA  1.0(  1864)
AUG 16.1( 29442)  ACG 19.1( 34980)  AAG 18.9( 34508)  AGG  2.4(  4404)

GUU  5.7( 10424)  GCU 11.0( 20094)  GAU 10.6( 19466)  GGU 10.5( 19226)
GUC 23.1( 42190)  GCC 56.4(103094)  GAC 37.2( 67990)  GGC 49.0( 89598)
GUA  2.8(  5136)  GCA 11.0( 20068)  GAA 19.0( 34716)  GGA  8.3( 15250)
GUG 49.1( 89754)  GCG 46.5( 84988)  GAG 38.5( 70354)  GGG 21.6( 39544)

Coding GC 66.84% 1st letter GC 70.52% 2nd letter GC 47.98% 3rd letter GC 82.01%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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