Shewanella denitrificans OS217 [gbbct]: 3754 CDS's (1280368 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 27.6( 35385)  UCU 10.9( 13993)  UAU 19.0( 24364)  UGU  5.3(  6777)
UUC 12.4( 15924)  UCC  6.1(  7839)  UAC 11.0( 14070)  UGC  4.8(  6190)
UUA 34.1( 43691)  UCA 12.3( 15722)  UAA  1.9(  2399)  UGA  0.4(   539)
UUG 20.2( 25862)  UCG  5.8(  7434)  UAG  0.6(   816)  UGG 11.9( 15186)

CUU 16.8( 21557)  CCU 13.1( 16748)  CAU 13.9( 17738)  CGU 13.0( 16588)
CUC 10.1( 12974)  CCC  8.5( 10891)  CAC  8.8( 11314)  CGC 13.6( 17454)
CUA 11.1( 14211)  CCA 11.6( 14798)  CAA 31.7( 40623)  CGA  4.3(  5516)
CUG 16.6( 21294)  CCG  5.5(  7064)  CAG 18.2( 23359)  CGG  2.8(  3633)

AUU 28.0( 35912)  ACU 15.2( 19488)  AAU 26.1( 33364)  AGU 15.2( 19484)
AUC 20.8( 26628)  ACC 20.6( 26325)  AAC 16.8( 21570)  AGC 19.1( 24397)
AUA 12.9( 16495)  ACA 10.7( 13649)  AAA 32.2( 41260)  AGA  5.7(  7236)
AUG 25.0( 32001)  ACG  6.7(  8575)  AAG 19.6( 25121)  AGG  3.8(  4893)

GUU 15.5( 19880)  GCU 21.5( 27553)  GAU 37.5( 47984)  GGU 22.9( 29315)
GUC 13.2( 16902)  GCC 34.7( 44392)  GAC 17.1( 21856)  GGC 29.3( 37564)
GUA 10.6( 13553)  GCA 19.0( 24357)  GAA 34.7( 44459)  GGA  6.0(  7669)
GUG 27.1( 34667)  GCG 17.4( 22232)  GAG 21.5( 27483)  GGG  9.5( 12151)

Coding GC 46.12% 1st letter GC 53.72% 2nd letter GC 38.71% 3rd letter GC 45.93%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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