Sphingopyxis alaskensis RB2256 [gbbct]: 6394 CDS's (2035968 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  8.9( 18208)  UCU  0.9(  1830)  UAU 15.9( 32364)  UGU  1.4(  2754)
UUC 26.2( 53434)  UCC  5.2( 10544)  UAC  5.2( 10528)  UGC  6.7( 13592)
UUA  0.4(   878)  UCA  1.5(  3074)  UAA  0.5(   996)  UGA  2.1(  4218)
UUG  7.7( 15706)  UCG 21.1( 43012)  UAG  0.6(  1180)  UGG 14.6( 29670)

CUU  9.5( 19300)  CCU  2.6(  5358)  CAU 10.0( 20282)  CGU  6.0( 12176)
CUC 34.7( 70574)  CCC 20.6( 41996)  CAC 10.2( 20728)  CGC 47.7( 97162)
CUA  1.0(  2076)  CCA  2.4(  4868)  CAA  4.8(  9762)  CGA  3.2(  6502)
CUG 44.2( 90086)  CCG 28.0( 56994)  CAG 23.9( 48744)  CGG 15.7( 31920)

AUU  6.4( 12942)  ACU  1.6(  3160)  AAU  9.4( 19210)  AGU  2.0(  4116)
AUC 42.9( 87406)  ACC 24.8( 50556)  AAC 14.4( 29290)  AGC 18.8( 38246)
AUA  1.7(  3434)  ACA  2.6(  5214)  AAA  6.9( 14024)  AGA  0.8(  1676)
AUG 24.2( 49226)  ACG 21.1( 42948)  AAG 22.3( 45306)  AGG  2.9(  5952)

GUU  5.8( 11728)  GCU  5.7( 11676)  GAU 19.8( 40326)  GGU  8.3( 16986)
GUC 38.5( 78346)  GCC 50.5(102768)  GAC 41.9( 85372)  GGC 57.1(116344)
GUA  1.8(  3616)  GCA 10.0( 20342)  GAA 26.2( 53296)  GGA  6.6( 13396)
GUG 24.3( 49518)  GCG 73.6(149842)  GAG 27.0( 55020)  GGG 16.8( 34170)

Coding GC 65.82% 1st letter GC 67.84% 2nd letter GC 48.28% 3rd letter GC 81.35%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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