Synechococcus sp. RCC307 [gbbct]: 2532 CDS's (700800 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 13.9(  9723)  UCU  3.8(  2660)  UAU  6.6(  4659)  UGU  2.5(  1731)
UUC 16.9( 11857)  UCC 10.0(  7014)  UAC 11.5(  8079)  UGC 10.0(  6974)
UUA  3.1(  2165)  UCA  5.6(  3909)  UAA  0.8(   581)  UGA  2.3(  1595)
UUG 29.1( 20418)  UCG  8.2(  5729)  UAG  0.5(   356)  UGG 18.1( 12712)

CUU  9.4(  6561)  CCU  9.2(  6451)  CAU  8.2(  5780)  CGU  9.4(  6594)
CUC 26.9( 18833)  CCC 21.4( 15000)  CAC 11.9(  8361)  CGC 37.4( 26196)
CUA  3.9(  2759)  CCA  9.9(  6949)  CAA 21.0( 14691)  CGA  3.5(  2473)
CUG 56.1( 39346)  CCG 16.3( 11450)  CAG 33.4( 23395)  CGG 14.0(  9783)

AUU 12.2(  8563)  ACU  3.9(  2721)  AAU  8.8(  6191)  AGU  6.6(  4660)
AUC 26.8( 18794)  ACC 26.0( 18216)  AAC 17.1( 11956)  AGC 29.3( 20550)
AUA  0.7(   496)  ACA  4.5(  3174)  AAA 10.4(  7307)  AGA  1.4(   976)
AUG 18.9( 13236)  ACG  8.7(  6102)  AAG 15.9( 11177)  AGG  3.0(  2097)

GUU 11.6(  8131)  GCU 23.3( 16360)  GAU 29.0( 20304)  GGU 16.4( 11487)
GUC 12.6(  8815)  GCC 54.0( 37861)  GAC 20.3( 14217)  GGC 46.1( 32287)
GUA  1.6(  1138)  GCA 10.5(  7338)  GAA 23.3( 16335)  GGA  8.6(  6022)
GUG 43.6( 30558)  GCG 21.7( 15220)  GAG 34.7( 24344)  GGG 13.4(  9383)

Coding GC 61.19% 1st letter GC 66.27% 2nd letter GC 45.90% 3rd letter GC 71.39%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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