Rhodopseudomonas palustris BisA53 [gbbct]: 4878 CDS's (1574990 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  7.6( 11937)  UCU  1.6(  2535)  UAU 10.7( 16924)  UGU  1.2(  1837)
UUC 28.6( 45071)  UCC 11.6( 18201)  UAC 10.7( 16873)  UGC  7.4( 11726)
UUA  0.6(   902)  UCA  2.2(  3472)  UAA  0.5(   742)  UGA  1.9(  2941)
UUG 13.0( 20493)  UCG 22.8( 35933)  UAG  0.8(  1195)  UGG 12.6( 19893)

CUU  5.0(  7833)  CCU  2.5(  3922)  CAU  8.8( 13913)  CGU  5.5(  8697)
CUC 25.4( 40043)  CCC 12.0( 18973)  CAC 11.0( 17362)  CGC 39.0( 61410)
CUA  1.9(  2978)  CCA  2.8(  4370)  CAA  7.2( 11279)  CGA  4.2(  6617)
CUG 54.9( 86474)  CCG 35.2( 55503)  CAG 26.4( 41519)  CGG 18.6( 29355)

AUU  6.7( 10555)  ACU  2.2(  3475)  AAU  9.1( 14266)  AGU  2.3(  3695)
AUC 45.0( 70919)  ACC 32.3( 50903)  AAC 17.6( 27689)  AGC 16.4( 25901)
AUA  1.0(  1601)  ACA  2.3(  3661)  AAA  8.1( 12722)  AGA  1.2(  1880)
AUG 22.7( 35755)  ACG 16.1( 25298)  AAG 26.9( 42430)  AGG  2.4(  3848)

GUU  4.9(  7780)  GCU  6.3(  9848)  GAU 19.1( 30090)  GGU  6.8( 10785)
GUC 32.3( 50821)  GCC 56.5( 89043)  GAC 37.6( 59230)  GGC 59.5( 93774)
GUA  1.8(  2768)  GCA  7.1( 11177)  GAA 22.0( 34675)  GGA  5.6(  8846)
GUG 34.6( 54525)  GCG 58.1( 91535)  GAG 30.9( 48615)  GGG 10.1( 15957)

Coding GC 65.00% 1st letter GC 65.38% 2nd letter GC 46.67% 3rd letter GC 82.94%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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