Simian type D retrovirus -Tsukuba [gbvrl]: 1 CDS's (660 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 31.8( 21) UCU 18.2( 12) UAU 21.2( 14) UGU 18.2( 12)
UUC 7.6( 5) UCC 6.1( 4) UAC 6.1( 4) UGC 1.5( 1)
UUA 24.2( 16) UCA 6.1( 4) UAA 0.0( 0) UGA 1.5( 1)
UUG 4.5( 3) UCG 4.5( 3) UAG 0.0( 0) UGG 21.2( 14)
CUU 10.6( 7) CCU 28.8( 19) CAU 16.7( 11) CGU 6.1( 4)
CUC 12.1( 8) CCC 12.1( 8) CAC 6.1( 4) CGC 6.1( 4)
CUA 7.6( 5) CCA 24.2( 16) CAA 40.9( 27) CGA 6.1( 4)
CUG 9.1( 6) CCG 12.1( 8) CAG 18.2( 12) CGG 1.5( 1)
AUU 19.7( 13) ACU 24.2( 16) AAU 25.8( 17) AGU 7.6( 5)
AUC 4.5( 3) ACC 18.2( 12) AAC 24.2( 16) AGC 6.1( 4)
AUA 9.1( 6) ACA 25.8( 17) AAA 54.5( 36) AGA 19.7( 13)
AUG 10.6( 7) ACG 0.0( 0) AAG 31.8( 21) AGG 3.0( 2)
GUU 16.7( 11) GCU 30.3( 20) GAU 42.4( 28) GGU 13.6( 9)
GUC 12.1( 8) GCC 25.8( 17) GAC 18.2( 12) GGC 12.1( 8)
GUA 19.7( 13) GCA 16.7( 11) GAA 45.5( 30) GGA 22.7( 15)
GUG 3.0( 2) GCG 7.6( 5) GAG 21.2( 14) GGG 16.7( 11)
Coding GC 43.69%
1st letter GC 54.24%
2nd letter GC 42.42%
3rd letter GC 34.39%
List of codon usage for each CDS
(format)
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