Shigella sonnei Ss046 [gbbct]: 4475 CDS's (1354174 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.9( 28265)  UCU  8.5( 11532)  UAU 16.4( 22179)  UGU  5.0(  6832)
UUC 16.8( 22687)  UCC  8.6( 11609)  UAC 12.7( 17179)  UGC  6.7(  9047)
UUA 12.8( 17277)  UCA  7.6( 10318)  UAA  2.1(  2856)  UGA  0.9(  1258)
UUG 12.7( 17235)  UCG  9.3( 12648)  UAG  0.3(   363)  UGG 15.6( 21102)

CUU 11.4( 15429)  CCU  7.0(  9502)  CAU 13.2( 17906)  CGU 21.4( 28951)
CUC 11.1( 14966)  CCC  5.5(  7454)  CAC 10.5( 14191)  CGC 22.4( 30391)
CUA  3.8(  5193)  CCA  8.3( 11221)  CAA 14.7( 19861)  CGA  4.0(  5409)
CUG 54.4( 73606)  CCG 23.2( 31365)  CAG 29.9( 40552)  CGG  6.7(  9042)

AUU 27.8( 37677)  ACU  8.9( 12062)  AAU 17.3( 23413)  AGU  9.0( 12172)
AUC 24.3( 32889)  ACC 21.7( 29381)  AAC 21.2( 28733)  AGC 15.7( 21311)
AUA  5.1(  6854)  ACA  7.5( 10140)  AAA 34.3( 46452)  AGA  2.8(  3845)
AUG 27.8( 37643)  ACG 15.1( 20510)  AAG 11.3( 15307)  AGG  2.0(  2770)

GUU 18.0( 24417)  GCU 15.5( 20974)  GAU 31.3( 42336)  GGU 23.9( 32397)
GUC 15.3( 20676)  GCC 24.8( 33608)  GAC 19.4( 26270)  GGC 28.0( 37927)
GUA 10.9( 14698)  GCA 20.0( 27132)  GAA 39.4( 53374)  GGA  8.8( 11923)
GUG 25.9( 35048)  GCG 32.4( 43893)  GAG 19.0( 25734)  GGG 11.2( 15182)

Coding GC 52.03% 1st letter GC 59.12% 2nd letter GC 40.83% 3rd letter GC 56.15%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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