Photobacterium profundum SS9 [gbbct]: 5497 CDS's (1749668 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 27.2( 47583)  UCU 14.6( 25542)  UAU 18.2( 31835)  UGU  7.4( 12901)
UUC 13.6( 23851)  UCC  3.3(  5816)  UAC 12.3( 21580)  UGC  4.1(  7177)
UUA 33.7( 58906)  UCA 15.4( 27027)  UAA  2.1(  3641)  UGA  0.5(   853)
UUG 17.3( 30334)  UCG  7.5( 13055)  UAG  0.6(  1003)  UGG 12.8( 22337)

CUU 18.7( 32638)  CCU 13.7( 23905)  CAU 13.9( 24337)  CGU 20.0( 35006)
CUC  7.1( 12426)  CCC  4.6(  8035)  CAC  9.0( 15689)  CGC  9.8( 17173)
CUA 13.4( 23469)  CCA 13.3( 23347)  CAA 29.8( 52224)  CGA  6.9( 12101)
CUG 12.8( 22414)  CCG  6.5( 11413)  CAG 14.6( 25600)  CGG  2.4(  4231)

AUU 37.1( 64932)  ACU 13.4( 23521)  AAU 27.0( 47301)  AGU 13.7( 23961)
AUC 19.2( 33640)  ACC 14.0( 24424)  AAC 17.7( 30948)  AGC 12.1( 21179)
AUA 10.4( 18268)  ACA 17.3( 30332)  AAA 38.5( 67364)  AGA  4.1(  7197)
AUG 26.6( 46467)  ACG 11.5( 20190)  AAG 15.9( 27794)  AGG  1.8(  3181)

GUU 25.7( 45029)  GCU 24.2( 42310)  GAU 41.1( 71982)  GGU 32.4( 56622)
GUC 10.1( 17663)  GCC 14.6( 25492)  GAC 13.8( 24219)  GGC 17.7( 30996)
GUA 16.8( 29445)  GCA 27.8( 48726)  GAA 42.9( 75083)  GGA  7.8( 13655)
GUG 15.5( 27033)  GCG 16.9( 29524)  GAG 16.5( 28858)  GGG  8.5( 14883)

Coding GC 42.68% 1st letter GC 52.90% 2nd letter GC 38.07% 3rd letter GC 37.07%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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