Alkaliphilus metalliredigens QYMF [gbbct]: 4625 CDS's (1363540 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 32.4( 44178)  UCU 12.9( 17639)  UAU 28.3( 38639)  UGU  6.6(  9059)
UUC  8.7( 11815)  UCC  7.0(  9559)  UAC  8.4( 11429)  UGC  2.5(  3468)
UUA 35.3( 48112)  UCA 12.1( 16529)  UAA  1.9(  2648)  UGA  0.5(   636)
UUG 15.4( 20948)  UCG  2.8(  3780)  UAG  1.0(  1353)  UGG  7.8( 10676)

CUU 15.0( 20457)  CCU 11.4( 15604)  CAU 14.5( 19839)  CGU  4.9(  6723)
CUC  4.8(  6514)  CCC  5.8(  7937)  CAC  4.3(  5869)  CGC  1.8(  2472)
CUA 15.7( 21412)  CCA 12.0( 16402)  CAA 23.6( 32173)  CGA  6.0(  8114)
CUG  8.1( 11031)  CCG  2.6(  3517)  CAG 11.2( 15269)  CGG  2.6(  3532)

AUU 47.3( 64507)  ACU 12.6( 17192)  AAU 35.3( 48160)  AGU 15.7( 21430)
AUC 18.6( 25424)  ACC 12.1( 16445)  AAC 12.8( 17515)  AGC  7.3( 10012)
AUA 24.0( 32658)  ACA 21.9( 29794)  AAA 46.1( 62868)  AGA 18.2( 24884)
AUG 29.4( 40033)  ACG  5.5(  7465)  AAG 27.4( 37381)  AGG  6.8(  9207)

GUU 21.3( 29008)  GCU 19.1( 26039)  GAU 39.9( 54357)  GGU 19.6( 26664)
GUC  8.4( 11420)  GCC 14.2( 19334)  GAC 12.1( 16444)  GGC  9.0( 12302)
GUA 22.8( 31110)  GCA 24.4( 33235)  GAA 54.3( 74036)  GGA 28.5( 38885)
GUG 16.3( 22253)  GCG  5.3(  7204)  GAG 23.7( 32258)  GGG 12.2( 16683)
Coding GC 37.43% 1st letter GC 47.53% 2nd letter GC 33.18% 3rd letter GC 31.58%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage