Silicibacter sp. TM1040 [gbbct]: 3864 CDS's (1223459 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.8( 24209)  UCU  6.4(  7805)  UAU 13.2( 16179)  UGU  2.9(  3511)
UUC 17.2( 21008)  UCC 12.7( 15578)  UAC  9.4( 11509)  UGC  6.3(  7732)
UUA  0.7(   855)  UCA  3.7(  4510)  UAA  0.8(  1007)  UGA  2.0(  2393)
UUG 13.5( 16469)  UCG 14.4( 17576)  UAG  0.4(   464)  UGG 13.6( 16652)

CUU 16.0( 19562)  CCU  5.8(  7040)  CAU 10.9( 13381)  CGU 10.3( 12659)
CUC 24.5( 30025)  CCC 16.9( 20649)  CAC  9.9( 12124)  CGC 35.0( 42871)
CUA  2.4(  2941)  CCA  5.7(  6964)  CAA  9.0( 11059)  CGA  3.5(  4337)
CUG 43.8( 53527)  CCG 20.5( 25072)  CAG 25.6( 31337)  CGG 12.8( 15707)

AUU 11.8( 14438)  ACU  4.1(  5047)  AAU  9.4( 11556)  AGU  3.3(  3982)
AUC 37.5( 45880)  ACC 28.9( 35372)  AAC 17.0( 20858)  AGC 14.8( 18057)
AUA  1.4(  1754)  ACA  6.9(  8483)  AAA 13.5( 16554)  AGA  1.4(  1759)
AUG 27.5( 33606)  ACG 14.5( 17785)  AAG 19.5( 23890)  AGG  1.7(  2115)

GUU 11.2( 13690)  GCU 11.1( 13559)  GAU 28.3( 34629)  GGU 14.3( 17451)
GUC 22.4( 27430)  GCC 44.1( 53984)  GAC 31.0( 37941)  GGC 42.9( 52525)
GUA  3.8(  4611)  GCA 19.3( 23642)  GAA 26.4( 32305)  GGA  7.3(  8947)
GUG 34.0( 41609)  GCG 45.5( 55691)  GAG 36.3( 44465)  GGG 18.9( 23132)

Coding GC 60.49% 1st letter GC 64.97% 2nd letter GC 45.17% 3rd letter GC 71.33%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage