Bartonella henselae str. Houston-1 [gbbct]: 1557 CDS's (488924 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 37.3( 18232)  UCU 20.6( 10073)  UAU 23.3( 11369)  UGU  7.5(  3687)
UUC  6.9(  3379)  UCC  6.0(  2946)  UAC  4.7(  2306)  UGC  3.1(  1513)
UUA 26.3( 12842)  UCA 14.5(  7070)  UAA  1.9(   907)  UGA  0.9(   457)
UUG 20.0(  9780)  UCG  5.1(  2474)  UAG  0.4(   193)  UGG 10.5(  5135)

CUU 31.0( 15175)  CCU 15.9(  7779)  CAU 18.8(  9170)  CGU 23.4( 11462)
CUC 10.5(  5157)  CCC  5.6(  2759)  CAC  5.1(  2477)  CGC 10.8(  5277)
CUA  5.2(  2559)  CCA 13.1(  6413)  CAA 29.2( 14279)  CGA  5.4(  2657)
CUG  6.2(  3020)  CCG  4.3(  2110)  CAG 11.3(  5549)  CGG  4.2(  2070)

AUU 46.0( 22485)  ACU 12.9(  6287)  AAU 33.4( 16327)  AGU 11.9(  5805)
AUC 14.6(  7150)  ACC  8.6(  4227)  AAC  9.6(  4716)  AGC  7.3(  3581)
AUA 13.6(  6652)  ACA 23.6( 11542)  AAA 45.7( 22344)  AGA  6.2(  3047)
AUG 24.3( 11859)  ACG  8.4(  4119)  AAG 15.0(  7346)  AGG  2.4(  1176)

GUU 32.9( 16074)  GCU 31.5( 15396)  GAU 42.5( 20769)  GGU 27.5( 13463)
GUC  8.3(  4050)  GCC 10.5(  5125)  GAC  7.2(  3523)  GGC 10.4(  5077)
GUA 11.7(  5735)  GCA 30.4( 14863)  GAA 45.4( 22208)  GGA 20.9( 10242)
GUG 11.5(  5638)  GCG 11.1(  5446)  GAG 14.7(  7184)  GGG 10.6(  5192)

Coding GC 40.08% 1st letter GC 52.75% 2nd letter GC 38.55% 3rd letter GC 28.95%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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