Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 [gbbct]: 2030 CDS's (604349 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  1.3(   793)  UCU  2.2(  1351)  UAU  3.3(  1982)  UGU  0.9(   563)
UUC 30.2( 18256)  UCC 17.0( 10293)  UAC 16.5(  9962)  UGC  4.7(  2835)
UUA  0.2(   132)  UCA  1.7(  1054)  UAA  0.3(   205)  UGA  2.3(  1389)
UUG  3.9(  2327)  UCG 19.1( 11558)  UAG  0.7(   436)  UGG 13.4(  8119)

CUU  4.4(  2667)  CCU  2.9(  1778)  CAU  3.4(  2030)  CGU  7.7(  4681)
CUC 48.4( 29271)  CCC 16.9( 10239)  CAC 15.6(  9456)  CGC 37.0( 22385)
CUA  0.9(   528)  CCA  2.5(  1530)  CAA  2.6(  1544)  CGA  4.1(  2457)
CUG 44.1( 26645)  CCG 31.1( 18812)  CAG 26.4( 15955)  CGG 21.9( 13212)

AUU  2.5(  1481)  ACU  3.0(  1815)  AAU  2.8(  1720)  AGU  2.1(  1274)
AUC 42.0( 25362)  ACC 31.1( 18809)  AAC 18.5( 11208)  AGC 16.4(  9891)
AUA  0.7(   431)  ACA  4.0(  2436)  AAA  5.0(  3045)  AGA  1.4(   821)
AUG 15.9(  9587)  ACG 21.6( 13036)  AAG 19.4( 11711)  AGG  2.8(  1673)

GUU  4.9(  2989)  GCU 11.0(  6659)  GAU 12.0(  7231)  GGU 10.9(  6617)
GUC 46.9( 28349)  GCC 57.3( 34659)  GAC 44.1( 26625)  GGC 50.8( 30700)
GUA  1.5(   923)  GCA  7.8(  4728)  GAA 11.2(  6758)  GGA  9.6(  5782)
GUG 35.1( 21219)  GCG 55.8( 33728)  GAG 45.1( 27276)  GGG 18.8( 11361)

Coding GC 68.39% 1st letter GC 69.30% 2nd letter GC 49.02% 3rd letter GC 86.86%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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