Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 [gbbct]: 1755 CDS's (536955 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 31.0( 16639)  UCU 11.1(  5970)  UAU 23.2( 12482)  UGU  3.0(  1616)
UUC 12.1(  6481)  UCC  4.3(  2322)  UAC 11.3(  6062)  UGC  1.1(   573)
UUA 40.0( 21489)  UCA 16.7(  8959)  UAA  2.3(  1213)  UGA  0.3(   147)
UUG 18.1(  9716)  UCG  5.6(  2984)  UAG  0.7(   395)  UGG  9.7(  5211)

CUU 14.0(  7540)  CCU 10.6(  5687)  CAU 14.5(  7766)  CGU 14.5(  7812)
CUC  4.3(  2317)  CCC  3.7(  2003)  CAC  5.2(  2795)  CGC  5.3(  2852)
CUA 12.5(  6711)  CCA 15.3(  8212)  CAA 34.3( 18400)  CGA  8.2(  4392)
CUG  4.3(  2310)  CCG  4.4(  2345)  CAG  8.3(  4481)  CGG  4.0(  2143)

AUU 53.2( 28551)  ACU 21.4( 11478)  AAU 36.7( 19694)  AGU 17.4(  9357)
AUC 17.5(  9387)  ACC 10.9(  5852)  AAC 15.5(  8349)  AGC  6.4(  3456)
AUA  6.5(  3478)  ACA 15.9(  8548)  AAA 46.5( 24984)  AGA  5.8(  3092)
AUG 27.0( 14498)  ACG 10.5(  5643)  AAG 22.3( 11952)  AGG  1.4(   730)

GUU 33.1( 17760)  GCU 31.7( 16998)  GAU 45.0( 24164)  GGU 26.1( 14032)
GUC  8.7(  4671)  GCC 12.0(  6431)  GAC 13.7(  7348)  GGC  9.0(  4819)
GUA 18.6(  9995)  GCA 20.8( 11165)  GAA 51.6( 27686)  GGA 23.4( 12589)
GUG 10.8(  5804)  GCG  9.2(  4959)  GAG  9.6(  5154)  GGG  8.0(  4306)

Coding GC 37.91% 1st letter GC 49.47% 2nd letter GC 34.77% 3rd letter GC 29.49%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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