Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 [gbbct]: 4038 CDS's (1331600 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 22.9( 30504)  UCU  9.9( 13167)  UAU 19.6( 26092)  UGU  5.6(  7422)
UUC 14.9( 19844)  UCC  7.3(  9744)  UAC  9.7( 12876)  UGC  4.6(  6082)
UUA 22.3( 29729)  UCA 10.7( 14307)  UAA  1.7(  2259)  UGA  0.9(  1188)
UUG 24.5( 32584)  UCG  7.0(  9360)  UAG  0.4(   592)  UGG 13.5( 18037)

CUU  9.4( 12507)  CCU 10.1( 13390)  CAU 14.1( 18711)  CGU 19.9( 26467)
CUC  8.9( 11802)  CCC  7.6( 10102)  CAC  8.4( 11198)  CGC 16.7( 22279)
CUA  8.0( 10653)  CCA 12.6( 16743)  CAA 24.3( 32371)  CGA  3.8(  5107)
CUG 35.9( 47782)  CCG 13.3( 17713)  CAG 24.4( 32495)  CGG  8.0( 10643)

AUU 31.5( 41928)  ACU 10.7( 14226)  AAU 24.8( 32990)  AGU 13.1( 17468)
AUC 23.0( 30584)  ACC 22.2( 29584)  AAC 16.6( 22090)  AGC 14.4( 19212)
AUA  7.7( 10243)  ACA  9.6( 12798)  AAA 31.9( 42535)  AGA  3.0(  3984)
AUG 25.6( 34153)  ACG 12.1( 16086)  AAG 11.6( 15391)  AGG  1.7(  2303)

GUU 19.0( 25254)  GCU 19.9( 26476)  GAU 37.4( 49771)  GGU 26.5( 35322)
GUC 15.7( 20887)  GCC 27.6( 36798)  GAC 14.3( 19072)  GGC 24.0( 31963)
GUA 11.2( 14905)  GCA 20.7( 27604)  GAA 34.3( 45617)  GGA  5.9(  7913)
GUG 22.8( 30394)  GCG 24.2( 32264)  GAG 20.3( 27004)  GGG 15.8( 21031)

Coding GC 48.84% 1st letter GC 56.49% 2nd letter GC 40.31% 3rd letter GC 49.71%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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