Thermoplasma volcanium GSS1 [gbbct]: 1526 CDS's (454874 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 25.4( 11576)  UCU 17.1(  7777)  UAU 25.5( 11616)  UGU  2.2(  1020)
UUC 21.8(  9908)  UCC 10.3(  4668)  UAC 21.8(  9931)  UGC  4.0(  1816)
UUA 13.7(  6251)  UCA 18.6(  8447)  UAA  1.5(   685)  UGA  1.3(   585)
UUG 11.8(  5359)  UCG  8.9(  4036)  UAG  0.6(   256)  UGG  8.3(  3784)

CUU 24.9( 11322)  CCU 11.7(  5337)  CAU  8.5(  3861)  CGU  3.2(  1436)
CUC 12.4(  5626)  CCC  4.0(  1827)  CAC  6.7(  3060)  CGC  2.4(  1099)
CUA 13.0(  5902)  CCA 14.5(  6589)  CAA  8.4(  3812)  CGA  2.3(  1024)
CUG 11.6(  5272)  CCG  7.3(  3313)  CAG 12.5(  5674)  CGG  1.8(   838)

AUU 21.7(  9864)  ACU 14.3(  6492)  AAU 26.0( 11838)  AGU  7.7(  3516)
AUC 14.5(  6588)  ACC  7.9(  3613)  AAC 21.4(  9737)  AGC 12.5(  5679)
AUA 55.8( 25378)  ACA 17.0(  7720)  AAA 34.0( 15446)  AGA 16.8(  7631)
AUG 27.0( 12292)  ACG  8.7(  3943)  AAG 34.8( 15825)  AGG 20.1(  9155)

GUU 24.1( 10944)  GCU 19.0(  8634)  GAU 36.9( 16785)  GGU 16.9(  7671)
GUC 10.4(  4731)  GCC 13.0(  5919)  GAC 17.7(  8068)  GGC 19.1(  8702)
GUA 25.0( 11369)  GCA 23.5( 10702)  GAA 40.2( 18289)  GGA 22.4( 10176)
GUG 11.8(  5389)  GCG  7.9(  3573)  GAG 23.1( 10503)  GGG 11.0(  4995)

Coding GC 40.99% 1st letter GC 46.70% 2nd letter GC 35.55% 3rd letter GC 40.71%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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