Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 [gbbct]: 4242 CDS's (1339312 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  2.9(  3844)  UCU  1.3(  1685)  UAU  9.1( 12161)  UGU  0.8(  1095)
UUC 31.8( 42626)  UCC  9.6( 12847)  UAC 10.2( 13621)  UGC  7.9( 10574)
UUA  0.2(   225)  UCA  0.8(  1068)  UAA  0.2(   291)  UGA  2.7(  3602)
UUG  2.6(  3543)  UCG 22.8( 30557)  UAG  0.3(   349)  UGG 13.9( 18600)

CUU  8.0( 10698)  CCU  2.5(  3398)  CAU  9.4( 12561)  CGU  4.2(  5591)
CUC 45.4( 60837)  CCC 22.8( 30600)  CAC 10.3( 13728)  CGC 42.1( 56398)
CUA  0.6(   766)  CCA  1.1(  1448)  CAA  2.1(  2794)  CGA  2.0(  2704)
CUG 51.5( 68970)  CCG 29.5( 39471)  CAG 26.7( 35710)  CGG 27.7( 37078)

AUU  2.4(  3218)  ACU  1.1(  1501)  AAU  4.4(  5937)  AGU  1.0(  1391)
AUC 42.1( 56419)  ACC 27.5( 36826)  AAC 15.8( 21220)  AGC 13.3( 17770)
AUA  0.5(   710)  ACA  1.5(  2004)  AAA  2.9(  3859)  AGA  0.9(  1163)
AUG 25.1( 33588)  ACG 21.1( 28215)  AAG 21.3( 28479)  AGG  2.7(  3655)

GUU  2.9(  3928)  GCU  4.5(  5967)  GAU 16.7( 22413)  GGU  4.7(  6350)
GUC 27.7( 37060)  GCC 64.4( 86278)  GAC 36.6( 49058)  GGC 59.6( 79807)
GUA  0.8(  1084)  GCA  6.0(  8067)  GAA 12.6( 16810)  GGA  5.2(  6966)
GUG 40.7( 54556)  GCG 61.2( 81974)  GAG 49.8( 66639)  GGG 20.1( 26960)

Coding GC 69.00% 1st letter GC 69.94% 2nd letter GC 48.65% 3rd letter GC 88.40%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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