Mycoplasma penetrans HF-2 [gbbct]: 1037 CDS's (401837 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 43.0( 17270)  UCU 28.6( 11499)  UAU 36.2( 14529)  UGU  6.4(  2556)
UUC 10.3(  4144)  UCC  1.0(   406)  UAC  8.3(  3351)  UGC  0.8(   325)
UUA 60.3( 24244)  UCA 26.8( 10753)  UAA  2.1(   843)  UGA  8.8(  3553)
UUG  8.7(  3477)  UCG  0.5(   199)  UAG  0.5(   194)  UGG  0.8(   302)

CUU 10.7(  4280)  CCU 10.6(  4262)  CAU  8.1(  3258)  CGU  1.2(   467)
CUC  0.3(   108)  CCC  0.7(   271)  CAC  2.9(  1171)  CGC  0.0(    15)
CUA  8.8(  3519)  CCA 14.0(  5618)  CAA 27.5( 11042)  CGA  0.1(    52)
CUG  0.9(   366)  CCG  0.3(   135)  CAG  1.9(   746)  CGG  0.1(    26)

AUU 59.6( 23956)  ACU 32.9( 13216)  AAU 66.7( 26784)  AGU 23.3(  9382)
AUC  9.0(  3626)  ACC  2.0(   785)  AAC 20.6(  8275)  AGC  4.1(  1665)
AUA 20.9(  8390)  ACA 25.9( 10419)  AAA 82.8( 33271)  AGA 21.3(  8576)
AUG 16.7(  6715)  ACG  0.3(   126)  AAG 12.5(  5026)  AGG  1.2(   492)

GUU 34.1( 13704)  GCU 22.7(  9117)  GAU 48.0( 19305)  GGU 22.3(  8945)
GUC  1.3(   512)  GCC  1.3(   515)  GAC  7.8(  3154)  GGC  1.5(   599)
GUA 19.1(  7691)  GCA 22.5(  9057)  GAA 54.6( 21936)  GGA 19.5(  7831)
GUG  3.6(  1455)  GCG  0.4(   157)  GAG  5.7(  2284)  GGG  4.7(  1890)

Coding GC 26.48% 1st letter GC 35.71% 2nd letter GC 30.66% 3rd letter GC 13.07%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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