Thermobifida fusca YX [gbbct]: 3111 CDS's (1034013 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  2.1(  2163)  UCU  2.7(  2773)  UAU  2.7(  2746)  UGU  1.2(  1220)
UUC 26.0( 26924)  UCC 19.3( 19914)  UAC 19.1( 19732)  UGC  6.9(  7155)
UUA  0.4(   455)  UCA  1.9(  1957)  UAA  0.5(   466)  UGA  1.9(  1962)
UUG  8.4(  8673)  UCG 10.3( 10621)  UAG  0.7(   683)  UGG 15.0( 15472)

CUU  4.4(  4557)  CCU  5.5(  5658)  CAU  2.5(  2615)  CGU  7.6(  7879)
CUC 37.5( 38748)  CCC 25.2( 26101)  CAC 20.7( 21450)  CGC 37.1( 38413)
CUA  1.6(  1617)  CCA  2.8(  2937)  CAA  4.7(  4908)  CGA  3.5(  3669)
CUG 51.4( 53180)  CCG 27.7( 28609)  CAG 25.2( 26032)  CGG 30.4( 31383)

AUU  3.2(  3265)  ACU  4.1(  4226)  AAU  1.3(  1392)  AGU  2.6(  2639)
AUC 34.9( 36090)  ACC 39.2( 40539)  AAC 18.1( 18711)  AGC 15.5( 16027)
AUA  0.6(   601)  ACA  2.9(  3049)  AAA  6.6(  6801)  AGA  1.2(  1193)
AUG 16.2( 16747)  ACG 13.6( 14065)  AAG 13.3( 13799)  AGG  2.1(  2178)

GUU  4.0(  4114)  GCU 12.0( 12456)  GAU  5.8(  5989)  GGU  9.4(  9713)
GUC 39.1( 40381)  GCC 59.1( 61091)  GAC 52.1( 53830)  GGC 40.8( 42233)
GUA  3.3(  3366)  GCA 11.2( 11591)  GAA 25.5( 26320)  GGA 11.4( 11838)
GUG 41.4( 42824)  GCG 43.1( 44583)  GAG 37.7( 38978)  GGG 22.0( 22712)

Coding GC 68.13% 1st letter GC 70.58% 2nd letter GC 48.92% 3rd letter GC 84.90%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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