Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 [gbbct]: 3841 CDS's (1297795 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU  7.7(  9932)  UCU  1.5(  1952)  UAU 12.5( 16280)  UGU  1.6(  2095)
UUC 26.3( 34090)  UCC 10.1( 13105)  UAC  6.7(  8724)  UGC  7.5(  9732)
UUA  0.9(  1153)  UCA  1.2(  1536)  UAA  0.8(  1062)  UGA  1.6(  2103)
UUG 15.5( 20140)  UCG 19.2( 24920)  UAG  0.5(   676)  UGG 12.5( 16286)

CUU 14.1( 18290)  CCU  2.4(  3087)  CAU 10.7( 13894)  CGU  5.9(  7706)
CUC 16.0( 20795)  CCC 25.7( 33325)  CAC  8.9( 11590)  CGC 44.6( 57862)
CUA  1.6(  2014)  CCA  2.0(  2597)  CAA  6.6(  8522)  CGA  2.4(  3079)
CUG 63.7( 82665)  CCG 26.7( 34589)  CAG 21.6( 28010)  CGG 19.9( 25823)

AUU  5.0(  6531)  ACU  1.4(  1765)  AAU  8.3( 10776)  AGU  2.0(  2595)
AUC 41.2( 53473)  ACC 37.4( 48566)  AAC 12.1( 15724)  AGC 16.7( 21718)
AUA  0.8(  1012)  ACA  1.2(  1586)  AAA  6.3(  8173)  AGA  0.7(   939)
AUG 22.1( 28714)  ACG 12.7( 16509)  AAG 21.5( 27915)  AGG  1.8(  2381)

GUU 10.1( 13110)  GCU  5.2(  6756)  GAU 28.4( 36894)  GGU  8.0( 10330)
GUC 34.2( 44345)  GCC 90.7(117688)  GAC 29.4( 38092)  GGC 58.1( 75426)
GUA  1.2(  1498)  GCA  1.9(  2523)  GAA 22.4( 29123)  GGA  6.8(  8794)
GUG 29.6( 38474)  GCG 34.5( 44790)  GAG 31.6( 41042)  GGG 17.6( 22899)
Coding GC 66.03% 1st letter GC 68.24% 2nd letter GC 48.16% 3rd letter GC 81.68%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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