Propionibacterium acnes KPA171202 [gbbct]: 2297 CDS's (764898 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  7.1(  5440)  UCU  7.8(  5989)  UAU  5.9(  4506)  UGU  3.8(  2928)
UUC 21.9( 16732)  UCC 16.9( 12965)  UAC 14.1( 10763)  UGC  7.1(  5410)
UUA  3.0(  2325)  UCA  6.6(  5041)  UAA  0.4(   271)  UGA  2.4(  1870)
UUG 14.5( 11055)  UCG 15.7( 12004)  UAG  0.2(   156)  UGG 16.3( 12451)

CUU 12.3(  9400)  CCU  8.6(  6616)  CAU  8.8(  6756)  CGU 17.2( 13134)
CUC 27.3( 20859)  CCC 15.4( 11794)  CAC 16.4( 12539)  CGC 23.0( 17569)
CUA  6.0(  4620)  CCA  8.0(  6108)  CAA  7.5(  5726)  CGA  8.7(  6692)
CUG 30.0( 22920)  CCG 20.8( 15914)  CAG 23.0( 17582)  CGG 12.4(  9466)

AUU 13.4( 10265)  ACU 11.3(  8606)  AAU  8.4(  6390)  AGU  5.0(  3795)
AUC 33.9( 25939)  ACC 31.8( 24338)  AAC 17.0( 12977)  AGC  9.9(  7564)
AUA  2.3(  1741)  ACA  5.7(  4334)  AAA  7.6(  5816)  AGA  2.4(  1805)
AUG 23.7( 18146)  ACG 14.4( 11006)  AAG 21.6( 16501)  AGG  4.5(  3424)

GUU 15.8( 12086)  GCU 25.9( 19823)  GAU 21.2( 16196)  GGU 21.5( 16413)
GUC 39.6( 30281)  GCC 48.2( 36878)  GAC 40.8( 31193)  GGC 30.2( 23115)
GUA  6.4(  4867)  GCA 13.7( 10480)  GAA 15.4( 11800)  GGA 15.8( 12073)
GUG 27.3( 20901)  GCG 22.2( 17013)  GAG 36.8( 28164)  GGG 17.5( 13367)

Coding GC 60.28% 1st letter GC 64.37% 2nd letter GC 47.06% 3rd letter GC 69.42%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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