Methanococcus maripaludis S2 [gbbct]: 1722 CDS's (492445 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 32.7( 16089) UCU 12.5( 6178) UAU 20.2( 9944) UGU 8.2( 4054)
UUC 9.2( 4527) UCC 4.9( 2433) UAC 17.9( 8800) UGC 5.4( 2641)
UUA 38.3( 18884) UCA 23.5( 11560) UAA 3.0( 1466) UGA 0.3( 135)
UUG 11.3( 5554) UCG 4.3( 2102) UAG 0.3( 130) UGG 6.5( 3191)
CUU 25.6( 12589) CCU 11.6( 5695) CAU 6.3( 3105) CGU 1.6( 800)
CUC 6.9( 3384) CCC 3.0( 1465) CAC 8.6( 4258) CGC 0.5( 251)
CUA 4.9( 2427) CCA 15.6( 7673) CAA 9.4( 4633) CGA 2.7( 1338)
CUG 3.9( 1940) CCG 3.7( 1840) CAG 9.2( 4549) CGG 1.3( 641)
AUU 48.4( 23817) ACU 16.9( 8313) AAU 36.5( 17958) AGU 10.3( 5049)
AUC 16.5( 8141) ACC 7.3( 3585) AAC 19.7( 9712) AGC 6.9( 3384)
AUA 28.8( 14173) ACA 19.4( 9535) AAA 78.6( 38715) AGA 17.8( 8788)
AUG 25.6( 12608) ACG 6.0( 2934) AAG 9.6( 4712) AGG 6.9( 3378)
GUU 35.7( 17593) GCU 14.1( 6949) GAU 39.4( 19386) GGU 16.5( 8140)
GUC 4.5( 2201) GCC 3.5( 1714) GAC 16.4( 8097) GGC 8.3( 4103)
GUA 24.6( 12109) GCA 35.8( 17620) GAA 74.0( 36457) GGA 35.2( 17322)
GUG 5.0( 2440) GCG 4.5( 2222) GAG 7.0( 3443) GGG 7.3( 3571)
Coding GC 34.01%
1st letter GC 44.67%
2nd letter GC 32.21%
3rd letter GC 25.17%
List of codon usage for each CDS
[CAUTION: The file is big (> 1000 entries).]
(format)
Homepage