Mesorhizobium loti MAFF303099 [gbbct]: 7281 CDS's (2185391 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  7.5( 16440)  UCU  2.2(  4845)  UAU 11.6( 25328)  UGU  1.3(  2872)
UUC 30.8( 67213)  UCC 12.1( 26376)  UAC 10.5( 22989)  UGC  7.3( 16025)
UUA  0.7(  1427)  UCA  3.3(  7186)  UAA  0.5(  1094)  UGA  2.0(  4446)
UUG 10.1( 22160)  UCG 22.0( 48108)  UAG  0.8(  1741)  UGG 13.6( 29708)

CUU 11.2( 24417)  CCU  4.4(  9628)  CAU 10.8( 23563)  CGU  6.9( 15121)
CUC 26.8( 58585)  CCC 12.5( 27416)  CAC  9.8( 21456)  CGC 36.6( 79985)
CUA  1.8(  4016)  CCA  4.5(  9929)  CAA  6.3( 13758)  CGA  4.0(  8691)
CUG 47.6(104018)  CCG 29.0( 63297)  CAG 24.8( 54184)  CGG 14.4( 31512)

AUU  7.6( 16638)  ACU  2.9(  6374)  AAU  9.9( 21572)  AGU  2.5(  5435)
AUC 43.3( 94567)  ACC 26.4( 57686)  AAC 17.2( 37654)  AGC 14.7( 32072)
AUA  2.8(  6126)  ACA  4.6( 10065)  AAA  8.2( 17863)  AGA  2.0(  4409)
AUG 24.1( 52761)  ACG 18.9( 41331)  AAG 28.6( 62581)  AGG  5.6( 12333)

GUU  7.6( 16534)  GCU  9.3( 20355)  GAU 19.7( 43115)  GGU  9.9( 21599)
GUC 37.3( 81436)  GCC 59.4(129749)  GAC 36.9( 80576)  GGC 59.9(130903)
GUA  2.5(  5386)  GCA 11.4( 24876)  GAA 23.0( 50333)  GGA  6.6( 14532)
GUG 26.5( 57975)  GCG 42.8( 93572)  GAG 30.6( 66764)  GGG  9.5( 20685)

Coding GC 63.25% 1st letter GC 64.43% 2nd letter GC 46.27% 3rd letter GC 79.04%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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